來源：3DM論壇
作者：batyeah
序幕
秘密檔案3作為一款解密遊戲來說，整體的遊戲情節倒是不如前幾作那麼緊張刺激；但是整體的遊戲性和畫面的表現度還是有著相當大的進步的
當玩家第一次開始遊戲之時，你可以選擇是否進行初始功能表自定義。AI會依據玩家幾個問題的回答而定制出來不同介面的初始功能表
而如果玩家不進行初始功能表的定義，那麼玩家的初始功能表則是如下的模式。這個自定義功能表選擇不會影響玩家的整體遊戲，只是一個美化的小插件而已
整體的遊戲流程沒有具體的章節之分，但是這裏我還是以主角尼娜 卡倫科夫在不同場景的冒險流程作為分部說明。總體流程比較長，一些重點位置我會給諸位玩家進行標注說明
亞歷山大城
西元前48年，愷撒命托勒密十三世與他的姐姐—-克利奧佩脫拉，共用埃及權利的行為，徹底激怒了埃及人，從而引發了足以毀滅該城的亞歷山大戰役。而古代最大的亞歷山大圖書館也在此戰役之中毀於一旦，我們的故事起源正是從這裏開始
在混亂的亞歷山大城陰暗的一角，兩個神秘人物交給一個竊賊秘密人物，40德本去燒毀城牆後面圖書館內部的一堆卷軸。而這個竊賊也頗為感到奇異，40德本的價格
這裏說明一下德本（古埃及的貨幣單位）。古埃及大部分是以物換物的交易，但是總體還是有以重量為衡量的計量單位的，德本與凱特。一德本相當與十凱特。
這一關總體的場景都比較簡單。作為解密遊戲其操控仍然是通過滑鼠點擊以及物品的互動而推進劇情。首先玩家需要點擊牆壁上的裂縫從而讓竊賊爬到城牆頂端
之後來到圖書館週邊平臺,這裏首先需要哪去附近馬舍外面的麻袋，之後用麻袋套取下方地圖的蛇；在返回馬舍入口把裝有蛇的麻袋扔到馬舍裏，從而門口守衛吸引其注意力
之後竊賊則是進入到下一個場景，圖書館內部
來到圖書館內部，此時玩家需要竊賊需要北部拿去亞麻布，之後於竊賊身上的鉤子以及繩子組合，前往地圖東部，將組合後的鉤子掛上窗戶之後進入到藏書室
之後則是劇情，竊賊按照委託人指示扔了一把火燒了整個密室，而無意之中，有一個卷軸掉落入下水道而沒有被燒毀
非尼斯泰爾
劇情推回到現代，我們的視角轉到妮娜的婚禮。
進入教堂，尼娜發現整個教堂居然幾乎空無一人，只有神父和他的丈夫。而當他去質問丈夫發生什麼事情之時，他的丈夫似乎中邪一樣讓尼娜慢慢等待
之後則是劇情，教堂突然塌陷，尼娜陷入了昏迷
醒來之後，妮娜發現神父和丈夫都不知所蹤。而教堂的出口被熊熊火焰堵住.下面妮娜要做的則是如何逃離教堂
首先撿取地圖東部的MOP，然後同左邊的火焰互動從而點燃MOP。，再用點燃的MOP將右部的油畫點燃從而打開上層的出口
然後則是在中間的水池，用聖杯接滿水；撲滅左邊架子上火焰，然後點擊拿取一個木板
之後撿取教堂右部座位上的衣架在雕像左邊的牆壁互動插出一條縫隙，之後將之前拿去的木板嵌入到裏面組成平臺；然後點擊雕像即可登上雕像頂部
之後則是遊戲的難度選擇，是選擇較易的遊戲難度還是有挑戰性的難度。然後則是晃動石像
這個看起來比較難懂，但是實際上就是一個技巧的問題。玩家需要在石像朝某一方向晃動到最大幅度之時的瞬間，立刻按反方向按鈕從而增加石像的搖擺幅度從而最終讓妮娜飛躍到對面的出口處。之後進行劇情
柏林
劇情閃回，妮娜從夢中蘇醒。原來這只是她作的一個噩夢。而此時突然他們的房間闖進來一群全副武裝的特種士兵將MAX抓了起來。而妮娜則為了尋找背後的真想不得不去調查MAX的秘密行為
首先則是搜查起居室。先檢查客廳門口的背包，點擊打開之後可以得到一本書；繼續點擊書可以得到特殊的四個標記和一頁筆記
這裏注意，按SPACE玩家可以快速得知整個區域可互動的物件
之後點擊筆記閱讀筆記。發現MAX筆記中地圖標記的貓膩
之後進入臥室，觀察臥室的澳大利亞地圖，將四個尺規分別插在Adelaide Brisbane Broome Hobart四個地點，之後發生劇情；密室出現，妮娜撿取到MAX在博物館辦公室的鑰匙
之後來到MAX的辦公室。玩家請按照如下步驟進行解密。首先使用鑰匙打開書桌右邊的抽屜，拿去抽屜裏面的所有物品（雜誌，相片，筆記本），以及記憶數位0504
之後觀察牆上的圖片，推進劇情。然後打開右邊冰櫃之上的熔岩燈
之後再開啟水族箱，將鑰匙放入到冰箱使其變為冰凍的鑰匙。
之後將鑰匙放入到中間的空調之中從而開啟中間牆壁圖片的暗格（注意將鑰匙與空調互動之前，本房間只能打開水族箱和熔岩燈）
之後閱讀密室中的資料，並且用手機撥號0504即可開啟劇情。原來MAX的大學同學正在土耳其進行某些秘密的研究。在MAX的同學提示之下，妮娜一路來到了土耳其
土耳其
土耳其和佛羅倫斯的路程都比較長，玩家在後面的解密過程一定請按照本文進行一步步的解析，否則必然會出現遊戲卡關的狀況
來到土耳其，首先拿取門口的鎖鏈
然後是搜索垃圾箱，得到鐵棍
然後把鐵棍同對面集裝箱鐵門下的縫隙互動，得到傳真碎片
下面就是本作經典的組合謎題了。這樣的謎題其實很簡單，因為玩家可以通過大體的碎片形狀來估算整個謎題的形狀
組合成完整的破頁之後，用電話與之互動開啟劇情。MAX的摯友原來此時被困在了地下的挖掘處，而尼娜所要做的則是先找到他所在的挖掘區域
下麵的路途就比較複雜了，先前往挖掘區
先到達B區，撿取紅泥土
然後到D區檢查挖掘機，之後來到E區，用video of tree roots 同樹木互動； smell of oil 與中間的泥土互動 ；engine sounds 與液壓泵互動
即可發現具體的位置
然後將挖掘器放置在中間的岩石區域之上，用鎖鏈與之互動相連，待用並且得到鑰匙
然後來到C區，用鑰匙打開電梯門
來到電梯通道之下，撿取木箱
將木箱放置在電梯之下，開啟電梯將其壓碎從而取得箱子裏面的物品
然後進入一旁的隧道
先用錘子與泥塊互動獲得粉末
然後用扳手與旁邊的水泵機互動得到壓力槍管
然後將錘子砸碎的粉末與壓力槍管互動，從而得到塗色的壓力槍管，然後裝回水泵機，與上面的藤條相連開啟水泵機器，離開本區域
然後來到D區，用鎖鏈和錘子組合與中間岩石的紅色標注區域互動
在回到原先的隧道區，此時中間多了一條鎖鏈與之互動即可推進劇情見到ERME
之後則是需要走石板開啟後面的巨石大門。這裏其實還是比較簡單的，玩家只需按照左右兩邊的動物標注即可
下面玩家可按照圖示進行相應解密
NINA先站上下方最左邊的踏板，然後踏上OX動物石板
切換到ERME，踏上老虎形狀石板
切換到NINA踏上朱璐石板
切換到ERME踏上老虎下方的狐狸石板
切換到NINA踏上右邊的野豬石板
切換到ERME踏上下方的鱷魚石板
切換到妮娜踏上左上方的蜻蜓石板
切換ERME踏上蝗蟲石板即可開啟大門
進入洞窟內部，用小島割去藤條，然後與蓋革計數器互動扔下洞窟即可測量下麵的輻射值
之後則是劇情，一幫不明身份的人襲擊了ERME和NINA，而ERME則被殺死。NINA則僥倖存活了下來
下麵我們則是要操控NINA逃離車廂。首先打開車燈
之後拉開遮陽板，拿去裏面的所有物品
用得到的梳子打開上方的雜物箱
在用從雜物箱得到的折疊尺將午餐盒勾過來
檢查午餐盒，得到小刀隔斷安全帶從而離開車子
之後檢查車子後面的金屬箱，打開手提電腦，閱讀郵件即可完成本章節推進劇情
NINA踏上前往三藩市的道路
佛羅倫斯
在前往三藩市的航班之上，妮娜陷入了夢境。此時我們回到了14世紀文藝復興時期義大利半島的佛羅倫斯
首先來到市場，將車子的下方的箱子移開，從而下落到對面的平臺
之後妮娜可以從車子登上上面的平臺檢查箱子，得到鹽塊
用鹽塊與下方平臺中間的木輪互動從而拉下上面平臺的活動木板
然後登上上平臺，越過木板將對面雕像上的劍拿下
然後下來，用劍砍斷箱子上的網，得到網
下面就是要如何救出信使的過程。首先將監獄右邊的桶子鬆開，從而將監獄的砸出一個缺口，推進劇情
注意由於妮娜是在夢境，該場景下任何人是看不到妮娜的
本作的解密基本沒有什麼捷徑，必須要按照步驟開啟劇情才能解開相應的謎題。故解密過程中的某些重複動作玩家是必須要做而且不能跳過的
進入監獄，首先拿去一旁平臺上面的頭盔
用之前袋子撿取的開口器,打開監獄外面的鋪位，得到特殊的藥草
然後用劍將之前木桶打破的窗戶再打破一次，從而讓冷空氣進入到監獄裏面，讓裏面的守衛生火
然後將之前的網與左邊的掛鈎互動，將網掛在上面，從而可以爬上監獄房頂
然後登上房頂用劍隔斷繩索，在下來將繩索割下來
得到繩索之後與之前撿取的掛鈎互動，從而組成繩索掛鈎組合
然後登上房頂，用繩索掛鈎組合勾住煙囪，從而可以爬到煙囪附近
爬上煙囪之後將藥草投進去從而，將裏面的守衛全部迷倒
之後就是如何釋放信使了。首先撿取鐵門外面的一個磚塊
然後用之前撿取的掛鈎與監獄門互動，從磚塊移除後的凹槽撬起鐵門，進入到監獄房間
下麵的路途就比較煩人了。因為你要一步一步追蹤信使的前進道路，先撿取牢房內的木桶。之後出監獄在拐角裝滿雪，從而組合成含有涼水的木桶
然後潑向信使。不過第一次潑的話你是無法找到他的。回到監獄門口，此時重新將木桶裝滿雪待命。之後觀察第一個岔道右邊牆上的石碑，用手機對其使用，吵鬧附近的居民即可獲得魚
之後魚與之前撿取的頭盔組合，再拿到市場與中間噴泉附近的貓互動即可逮住貓
之後將魚放到信使身上，即可將涼水再一次潑到他身上。然後回到第一個岔道釋放貓在地面上即可得知信使是直走的
第二個岔道比較簡單，將桶裝滿雪水潑到地面，然後在潑醒信使即可得知他是從右邊的路途前進的
第三個比較麻煩。首先需要在監獄的火堆附近撿取取得灰燼。然後來到第三個岔道的三個大門之前，在任意大門互動放置灰燼
之後再澆醒信使，調查左邊大門上面的痕跡，即可發現信使是從左邊大門出去的
在最後一個分叉。首先需要在第二關場景拿去梯子；然後放置在最後岔道的中間大門處，然後爬上中間大門屋頂上清除掉積雪
之後澆醒信使調查地上的足跡即可發現他是從右邊的出口到達目的地的。到此，追蹤信使的部分結束
妮娜發現了最終的交貨地點
進入房間首先拿去左邊桌子上的工具，然後用點火器將右邊的油燈點亮
然後再拿取右邊的千斤頂從而頂其車子
之後拿取車子頂起之後露出的鑿子，然後與中間牆上的轉盤右部互動，讓左邊的平臺落下得到其中的滾筒
之後就是捲筒的解密了。但是進行解密之前務必要先觀察內部房間上面的壁畫，否則無法推進劇情
然後觀察開啟滾筒
之後請按照如下步驟開啟滾動。第二個按鍵按五下，第三個按鍵按一下，第五個按鍵按四下即可打開滾筒，得到裏面的書頁
下面的步驟就是複製書頁了。首先拿去左邊的顏料箱，在拿取門前的拐杖（道具的拿取無次序，但是互動有順序）
將拐杖與顏料互動，得到帶有顏料的拐杖，然後與中間的畫板互動從而塗上畫板
然後將書頁與已經塗上顏料的畫板互動，得到複製的書頁。然後拿取左邊書架上古老的書籍
用書籍與複製的書頁互動從而推進劇情。神秘者再次出現，而妮娜的夢境也至此結束
