來源:vgtime
1-10話
第1話：特務三課的第一天
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：暴君旋風遭擊墜
- 敵方初期配置：賽格德（4）
- 敵方增援：蚱蜢（4），魔神（2）
- 我方初期配置：暴君旋風
- 我方增援：巨型博爾霍克，大魔神，一七式
- SR獲得條件：通過關卡前，使用過暴君旋風的所有武器
沒有難度的新手關卡，讓暴君旋風站在有地形效果的地面上可以增加些防禦和閃避以防萬一。記得使用暴君旋風每種武器各一次來獲得此關SR。隨後雙方增援出現，注意魔神有特殊能力，會抵消傷害。
第2話：賞金獵人的藍調
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：任一我方機體遭擊墜
- 敵方初期配置：蚱蜢(4)，魔神（3）
- 敵方增援：積屍氣（4）
- 我方初期配置：劍魚II
- 我方增援：暴君旋風，大魔神，撫子B，超級艾斯特巴厘斯，艾斯特巴厘斯特裝型
- SR獲得條件：使用撫子B的支援攻擊來擊墜敵人，支援攻擊前便被擊墜的機體不算
一開始只有劍魚II一架機體，直接往前沖即可。隨後雙方增援出現，積屍氣有特殊能力-次元歪曲防壁，控好血量，在攻擊前保存好，使用艾斯特巴厘斯的機槍配合撫子B的重力波炮支援攻擊擊墜一架敵機即可獲得此關SR。
第3話：燕尾服在火星舞動
- 勝利條件：1.全滅敵人 2.擊墜巨星高達
- 失敗條件：任一我方機體遭擊墜
- 敵方初期配置：德瓦基（2），包茲（2），卡薩C（2），賽洛德（3）
- 敵方增援：1.巨星高達 2.賽格德（4）
- 我方初期配置：神威高達，諾貝爾高達
- 我方增援：1.暴君旋風，大魔神 2.Dann of Thursday
- SR獲得條件：通過關卡前任意機體擊墜4架以上的敵機
一開始只有神威高達和諾貝爾高達，1回合後巨星高達出現，神威高達會直接滿氣可以使用爆熱神威掌。我方機體都非常強力，可以任意選擇喜歡的機體來達成SR。隨後出現4架敵機，但增援的Dann非常強力，完全可以單挑。
第4話：戰爭的紅色荒野
- 勝利條件：1.全滅敵人 2.擊墜天龍高達
- 失敗條件：任一我方機體遭擊墜
- 敵方初期配置：積屍氣（4），蚱蜢（6）
- 敵方增援：1.天龍高達 2.積屍氣（4），六連（2)
- 我方初期配置：暴君旋風，大魔神，神威高達，劍魚II，諾貝爾高達，Dann of Thursday
- 我方增援：黑百合
- SR獲得條件：4回合全滅敵人
和上一關一樣，只是換成了天龍高達，但神威高達命中很低，要多利用精神提升命中率。SR獲取的時間有限，記得利用支援攻擊來快速擊破敵機。擊墜飛龍高達後黑百合出現，會大大增強我方實力。
第5話：哈洛克船長
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：1.阿爾卡迪亞號遭擊墜 2.任一我方機體遭擊墜
- 敵方初期配置：賽格德（12），傑鋼（4）
- 敵方增援：無
- 我方初期配置：阿爾卡迪亞號
- 我方增援：暴君旋風，大魔神，神威高達，劍魚II，諾貝爾高達，Dann of Thursday，黑百合，玫瑰高達
- SR獲得條件：通關前，我方任意單位Exc提升到5以上
SR的獲取方法是擊破和升級來獲得5點Exc，讓強力的阿爾卡迪亞號擊墜就好，也可以順便提升哈洛克的擊墜數。
第6話：齊聚骷髏旗下
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：1.任一我方機體遭擊墜 2.阿爾卡迪亞號遭擊墜
- 敵方初期配置：賽格德（4），傑鋼（3）
- 敵方增援：傑鋼（4），積屍氣（4），康古裡久（1），佩茲-巴塔拉（2），巴塔拉（4）
- 我方初期配置：量產型高達F91，海盜高達X1改-改，雷霆高達
- 我方增援：阿爾卡迪亞號+6機，劍魚II
- SR獲得條件：三回合全滅敵人
同樣有時間限制的一關，但後方的傑鋼一開始是不會行動的，需要我方主動靠近並擊墜來保證時間足夠。本關結束後援系統解鎖，不參戰的npc每回合可施加一個精神來支援前線。
第7話：復仇在我
- 勝利條件：1.全滅敵人 2.擊墜血之搖籃
- 失敗條件：1.任一我方機體遭擊墜 2.阿爾卡迪亞號遭擊墜 3.Dann of Thursday遭擊墜
- 敵方初期配置：朵拉古魯（6），蚱蜢（10）
- 敵方增援：血之搖籃
- 我方初期配置：大魔神，神威高達，諾貝爾高達，Dann of Thursday，布朗尼
- 我方增援：阿爾卡迪亞號+5機
- SR獲得條件：通過關卡前，我方任一單位在我方階段一回合內擊墜3台以上
通過擊墜敵機來獲得Exc點數，並使用2次“多重行動”來擊墜3台敵機即可獲得SR，敵軍數量有限，要好好分配好擊墜人員。
第8話：火星狂想曲
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：1.阿爾卡迪亞號遭擊墜 2.暴君旋風，黑百合，Dann of Thursday中任意一位遭擊墜 3.我方戰艦遭擊墜
- 敵方初期配置：六連（2），積屍氣（3），魔神（3），朵拉古魯（3），蚱蜢（8），佩茲-巴塔拉（2），巴塔拉（4）
- 敵方增援：伊比特γ，光子戰鬥艦，夜天光
- 我方初期配置：阿爾卡迪亞號+7機，暴君旋風，黑百合，Dann of Thursday
- 我方增援：撫子B，超級艾斯特巴厘斯，艾斯特巴厘斯特裝型
- SR獲得條件：3回合內擊墜12台以上敵機
在3回合內擊破初期敵機就可以達成SR條件。擊墜16架敵機後撫子B增援。用主角機擊墜伊比特γ可以解鎖新的武裝。本關結束後阿爾卡迪亞號、黑百合會離隊。
第9話：傳送門追逐戰
第1部分
- 勝利條件：1.在4回合以內全滅敵人
- 失敗條件：1.撫子B遭擊墜 2.迎來第5回合
- 敵方初期配置：賽格德（6），卡薩C（6），蚱蜢（6）
- 我方初期配置：撫子B+10機
- SR獲得條件：3回合以內過關
但時間有限，迅速擊破敵人即可
第2部分
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：劍魚II遭擊墜 2.敵方單位抵達關卡上方邊緣
- 敵方初期配置：賽格德（4），
- 我方初期配置：劍魚II
- SR獲得條件：無
劍魚II一開始就有10點Exc。“多重行動”和最終武器可以直接在一回合內全滅敵機。
第10話：新吉翁的陰影
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：撫子B遭擊墜
- 敵方初期配置：卡薩D（8），茲沙（4），德萊森（3），德萊森（奧古斯特）
- 敵方增援：巴塔拉（4），佩茲-巴塔拉（2），丘貝雷MKII
- 我方初期配置：撫子B+11機
- 我方增援：高達Z，高達MKII，梅塔斯
- SR獲得條件：過關前，用撫子號的“重力波炮”同時擊墜兩台以上
留兩架殘血敵機給撫子B收割即可獲得SR。重力波炮需要120氣力，也要有人使用“感應”來確保撫子號能夠命中。另外最好用捷多擊墜丘貝雷MKII。
11-20話
第11話：來自遠方星球的災厄
- 勝利條件：1.全滅敵人
- 失敗條件：1.撫子B遭擊墜 2.我王凱牙遭擊墜
- 敵方初期配置：蚱蜢（4），巴塔拉（4），魔神（3），茲沙（4)，康古裡久（2），卡薩C（4）
- 敵方增援：卡薩D（3），包茲（1），T蓋爾5656（1），忍者（1）
- 我方初期配置：撫子B+14機，
- 我方增援：我王凱牙
- SR獲得條件：通關前，我方任意一名駕駛員在敵方單回合擊墜3台以上
讓一架最厲害的機體到敵軍深處，第1回合使敵人殘血，第2回合再擊墜即可達成SR。我王凱牙很強力，增援的敵人全部交給他沒問題。
路線分歧
- （A） 地球團隊：撫子B小隊，大魔神，我王凱牙，高達鬥士小隊（超級系路線）
- （B） 宇宙團隊：高達Z小隊，骷髏尖兵小隊（真實系路線）
此處選擇了A路線。
第12話（A）：無敵！懷抱勇氣的人們
- 勝利條件：1.擊墜史諾比 2.擊墜EI-15
- 失敗條件：1.任一我方機體遭擊墜 2.撫子B遭擊墜 3.我王凱牙遭擊墜
- 敵方初期配置：史諾比，T蓋爾5656（2），忍者（2），包茲（2），弗洛瑪姬（2）
- 敵方增援：EI-15, 終極音速號8823（6），斯塔克4126（3）
- 我方初期配置：巨型博爾霍克，超龍神，托萊達G7，太空梭
- 我方增援：1.特急勇者，戰鬥猛獸機器人，急救列車機器人 2.我王凱牙，撫子B+8機
- SR獲得條件：4回合內擊墜全部敵人再擊墜史諾比
4回合內除了對付雜兵外還需要適當削減史諾比的血量，方便打倒其他敵機後收割。達成SR條件後勝利條件更改，EI-15帶著雜兵出現。留意在後方的太空梭別被擊墜了。
第13話（A）：復活的Z
- 勝利條件：1.全滅敵人
- 失敗條件：1.撫子B遭擊墜 2.大魔神遭擊墜 3.大魔神，魔神Z遭擊墜
- 敵方初期配置：加拉傑克多V2(15)
- 敵方增援：加拉傑克多V2（4），達姆達姆L2
- 我方初期配置：撫子B+12機，大魔神，一七式
- 我方增援：魔神Z
- SR獲得條件：通關前，將任意一架滿血的加拉傑克多（雜魚機械獸）一擊擊墜，可組合使用支援攻擊，再攻擊
由於還是遊戲初期，因此沒有“熱血”“魂”等加傷害的精神，同樣也沒有可以再攻擊的機體，因此這關要多保存。推薦改造一下神威高達，滿氣後的“爆熱神威掌”和支援攻擊來一擊打倒敵人就可以達成SR條件。
13話結束後兩條路線匯合。
第14話：最大恐怖降臨
- 勝利條件：擊墜ZX-01和宗師高達
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.我王凱牙，神威高達任一位遭擊墜
- 敵方初期配置：1.ZX-01，EI-15（12） 2.宗師高達，死亡軍團（16）
- 敵方增援：無
- 我方初期配置：撫子B，拉凱拉姆+10機，我王凱牙，神威高達
- 我方增援：天龍高達，玫瑰高達，雷霆高達，巨星高達
- SR獲得條件：我方擊墜28台以上敵機，擊墜宗師高達或ZX-01後，所屬的敵機會爆炸。
敵人眾多的一關，雖然可以利用兩方敵對的關係，但敵機數量有限，因此要注意不要讓其中一方收割了殘血的敵機以免SR條件中的敵機數量不夠。宗師高達非常強力，需要小心應對。
戰鬥開始後宗師高達和ZX-01會互相接近，但當擊墜一半死亡軍團後，洗牌同盟會出來，宗師高達也會接近神威高達。而擊墜一半EI-15後也會有劇情。ZX-01有每回合恢復20%血量的能力，因此最好在1回合內集火擊墜。注意先清雜兵再擊墜boss機體。
第15話：天空墜落之日
- 勝利條件：6回合以內全滅敵人
- 失敗條件：1.任一我方機體遭擊墜 2.迎來第7回合 3.宗師高達，
- 敵方初期配置：丘貝雷MKII，杜班-烏爾夫，德萊森（奧古斯特），魔神（4），六連（2），茲沙（6），薩克III（3），德萊森（6），巴塔拉（4），佩茲-巴塔拉（2）
- 敵方增援：伊比特α（4），伊法斯
- 我方初期配置：阿爾卡迪亞號，黑百合，宗師高達
- 我方增援：1.撫子B，拉-凱拉姆+12機，暴君旋風，海盜高達X1改-改，Z高達，ZZ高達 2.擊龍神，真蓋塔
- SR獲得條件：5回合內過關
宗師高達在敵方時很強力，但在我方時就削弱得厲害了，但對付一開始位於他附近的敵機還是完全沒問題，但要注意血量及EN消耗，後面打Boss還需要他。阿爾卡迪亞號這邊黑百合也可以直接使用”不屈“往前沖。第2回合我方大部隊登場，讓補給的機體出擊在最靠近宗師高達的位置，方便一會給他恢復EN。移動力高的主力機體靠近boss，雜兵交給後面腿短的。用捷多擊墜丘貝雷MKII會有劇情。
路線分歧
- （A） 加入治安維持隊：撫子B，拉-凱拉姆，高達Z小隊，魔神團隊，GGG，特急勇者小隊，竹尾通用公司小隊，艾斯特巴厘斯小隊
- （B） 加入自由遊擊隊：阿爾卡迪亞號，牛仔，鎧甲勇士，高達鬥士小隊，骷髏尖兵小隊，蓋特小隊，黑百合
此處選擇了A路線。
第16話（A）：門開啟之時
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：我方戰艦遭擊墜
- 敵方初期配置：伊比特α（8），伊比特γ（8），伊法斯
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆+15機
- SR獲得條件：過關前，我方任一駕駛員在我方回合擊墜3架以上敵機
讓一架機體累積Exc點數到5，使用兩次“多重行動”來擊破3架敵機即可完成SR條件。
第17話（A）：巴朗巴朗的秘寶
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：1.薩拜因遭擊墜 2.我方戰艦遭擊墜
- 敵方初期配置：魔像（6）
- 敵方增援：魔像（18）
- 我方初期配置：薩拜因
- 我方增援：撫子B，拉-凱拉姆+15機
- SR獲得條件：2回合內擊墜3台魔像
沒有難度的SR條件。薩拜因的精神不要節約，以免不小心被擊墜，記得保存。我方增援出現後薩拜因最好靠近，不然會被附近的魔像圍攻。
第18話（A)：魔法騎士的使命
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.薩拜因遭擊墜
- 敵方初期配置：魔像（12）
- 敵方增援：德拉姆洛（10），畢亞雷斯，雷普拉甘（潔麗露），雷普拉甘（亞連）
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆+15機，薩拜因
- SR獲得條件：在通關前的同一回合內擊墜畢亞雷斯，雷普拉甘（潔麗露），雷普拉甘（亞連）
將3台boss機體打到殘血，一回合收割就可以達成SR條件，其餘的就是雜兵機體，當成刷擊墜數即可。
第19話（A）:覺醒的傳說
- 勝利條件：1.全滅敵人 2.擊墜伊諾巴
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.雷阿斯，瑟雷斯，威達姆任一遭擊墜
- 敵方初期配置：德拉姆洛（8），魔像（160
- 敵方增援：魔像（8），伊諾巴
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆+15機
- 我方增援：雷阿斯，瑟雷斯，威達姆）
- SR獲得條件：2回合內擊墜18架敵機
2回合的時間足夠用來將雜兵打殘血，在敵方回合時擊墜，數量達到18架即可達成SR條件。雷阿斯，瑟雷斯，威達姆還是很強力的，和我方一起擊墜伊諾巴即可過關。
第20話（A）：漆黑野心
- 勝利條件：1.擊墜雷普拉甘（拉邦）
- 失敗條件：1.比爾拜因，丹拜因任一遭擊墜 2.我方戰艦遭擊墜
- 敵方初期配置：德拉姆洛（12），雷普拉甘（拉邦）
- 敵方增援：1.畢亞雷斯 2.雷普拉甘（潔麗露），雷普拉甘（亞連），魔像（15）
- 我方初期配置：比爾拜因，丹拜因
- 我方增援：畢亞雷斯（加入我方），撫子B，拉-凱拉姆+12機，雷阿斯，瑟雷斯，威達姆，薩拜因
- SR獲得條件：6回合內擊墜全部敵人，再擊墜雷普拉甘（拉邦）
由於擊墜畢亞雷斯後雙方增援就會出現，為了節約時間，最好在2回合左右內優先擊墜，然後和大部隊一起來消滅剩下的敵機，最後擊墜雷普拉甘（拉邦）來
達成SR條件。我方有很多機體是失敗條件，注意這些機體不要衝太前面了以免遭到圍攻。20話結束後路線匯合。
21-30話
第21話：心中的小小火焰
- 勝利條件：1.伊法斯的HP降至30%以下 2.全滅敵人
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.雷阿斯，Cyzler黑，GunBuster任一位遭擊墜
- 敵方初期配置：伊比特α（6），伊比特γ（6）
- 敵方增援：1.宇宙怪獸兵隊（10） ，宇宙怪獸上陸艇 2.宇宙怪獸巡洋艦級，宇宙怪獸兵隊（8） ，宇宙怪獸上陸艇
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號+15機，雷阿斯
- 我方增援：1.Cyzler黑 2.GunBuster
- SR獲得條件：在通過關卡前，使用地圖兵器，同時擊墜3架以上敵機
先擊墜幾架敵機來積攢氣力，以便我方使用地圖兵器，將地圖兵器攻擊範圍內的敵機打殘血，然後擊墜即可得到SR點數，注意使用“感應”或者必中來避免失誤。伊法斯的血量低於30%會有劇情，血量回滿，但會在下次低於30%時撤退，因為有強化零件，因此最好擊墜，伊法斯被擊墜或撤退後，雷阿斯會移動位置與Cyzler黑會合並學會新技能，在下一回合GunBuster出場，可以直接沖入敵群。
第22話：為誰而戰
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.Z高達，ZZ高達任一位遭擊墜
- 敵方初期配置：丘貝雷，薩克III改，夜天光，薩克III（3），德萊森（4），茲沙（4），康古裡久（2），巴塔拉(4)，佩茲-巴塔拉（2），積屍氣（3），
- 魔神（4），六連（2）
- 敵方增援：無
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號+15機，Z高達，ZZ高達
- 我方增援：無
- SR獲得條件：在4回合以內，通過關卡
由於時間有限，因此出擊時要分配好主力人員朝哈曼和夜天光前進，建議讓巨型博爾霍克出戰，他的“溶解警笛”技能可以方便我方對北辰等人有“次元歪曲防壁”的機體造成更多傷害，看準時機使用即可。至於左邊的可以交給較弱的機體應對，在我方回合趕路及將滿血的敵機打殘，在敵方回合進行反擊收割，記得用捷多來擊墜丘貝雷及薩克III改，會有劇情。
第23話：毒與毒與毒
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.我王凱牙，戒特王任一位遭擊墜
- 敵方初期配置：EI-15（12）
- 敵方增援：1.侵略者（15） 2.機界原種（5）
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號+15機
- 我方增援：戒特王
- SR獲得條件：通過關卡前，任一駕駛員的ExC達到10
和之前類似的關卡一樣，任何機體擊墜敵機或升級來累計ExC到10即可得到SR點數。達成SR條件後敵方再次出現增援，而我王凱牙也會強化。
第24話：不回來的日子
- 勝利條件：1.擊墜Diablo of Monday 2.全滅敵人
- 失敗條件：1.Dann of Thursday遭擊墜 2.我方戰艦遭擊墜
- 敵方初期配置：Diablo of Monday
- 敵方增援：1.朵拉古魯（7），加拉傑克多V2（8），屠殺者F9 2.伊諾巴，雷普拉甘（亞連) 4，德拉姆洛（4），魔像（4） 3.阿修羅P1
- 我方初期配置：Dann of Thursday
- 我方增援：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號+15機
- SR獲得條件：在3回合內，擊墜15架以上敵機。
24話前記得強化一下Dann，以免陷入苦戰。第2回合我方增援到達後Dann立刻往朵拉古魯的方向移動，大部隊留4架強力機體在左側等待敵方伊諾巴的增援，其餘的也往加拉傑克多V2方向移動，確保在我方回合能夠削減敵方雜兵的血量，在敵方回合行動時任何我方機體都能夠反擊擊墜敵機，15架還是很輕鬆的。阿修羅P1登場後Dann和Diablo會移動位置，Dann會學會新技能並恢復SP，因此前面就不必節約了。
第25話：???/專案TND凍結
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：1.任一我方機體遭擊墜 2.亡靈遭擊墜 3.我方戰艦遭擊墜
- 敵方初期配置：1.賽格德（8）
- 敵方增援：伊比特α（10），伊比特β（10），伊法斯ε
- 我方初期配置：暴君旋風，亡靈
- 我方增援：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號+15機
- SR獲得條件：在6回合以內通過關卡
一開始的敵人打得越快，後面留給我方的時間就越充足，記得出擊一個有“預見”精神的來代替劇情撤退的暴君旋風。本關沒有boss，因此在時間限制內全滅敵機即可過關和獲得SR。注意讓落單的亡靈往大部隊靠近，不然很容易被擊墜。
第26話：公司和我的幸福
- 勝利條件：1.全滅敵人 2.擊墜伊法斯ε
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜
- 敵方初期配置：伊比特α（12），伊比特β（12），亞皮耶斯
- 敵方增援：伊比特α（3），伊法斯ε
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號+16機
- 我方增援：暴旋霸王
- SR獲得條件：在通過關卡前，獲得資金12w以上。
讓有“幸運”及“祝福”的機體全部上場，劍魚II也必須上場。要獲得此關SR就要記得在給敵機最後一擊時使用“幸運”或“祝福”。同時也要儘量讓阿爾卡迪亞號和劍魚II進行擊墜。還有後援精神“資金回收”也會對達成SR條件有很大幫助，但注意這些效果不會疊加，只會觸發其中最高的倍數，看準時機使用。最後請用暴旋霸王與伊法斯ε交戰一次，然後擊墜，這是關係到IF路線能否開啟的條件之一。
第27話：樂園與流放者
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：我方戰艦遭擊墜
- 敵方初期配置：艾克魯比斯，法提（10），直立陸龜（6），眼鏡鬥犬（6）
- 敵方增援：Arhan（10）
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號+16機
- 我方增援：新型Arhan
- SR獲得條件：在4回合內通過關卡
一開始除了往下方移動外還要派出幾架機體往右側移動，一會的敵方增援就會出現在那。強化後的新型Arhan很強力，和大部隊一起在回合限制內將剩下的敵機全部擊墜。
第28話：決戰火星極冠遺跡
- 勝利條件：1.在3回合以內，，黑百合進入遺跡（地圖上白色區域)
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.黑百合或劍魚II遭擊墜 3.迎來第4回合
- 敵方初期配置：積屍氣(10)，魔神(8），蚱蜢(12)
- 敵方增援：1.漢謨拉比，眼鏡鬥犬（6），直立陸龜（6） 2.夜天光，六連（6）
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號+16機，黑百合，劍魚II，眼鏡鬥犬
- 我方增援：撫子C
- SR獲得條件：在達成勝利條件前擊墜20架以上敵機
28話前記得強化一下黑百合，因為要單獨沖入敵陣，記得加移動力的強化零件也要裝上。注意SR獲得需要在黑百合進入遺跡前達成，因此我方一開始就要
分散開來往前推進。還是帶上巨型博爾霍克並看準時機使用“溶解警笛”。20架敵機主要以血少的蚱蜢和增援的眼鏡鬥犬及直立陸龜為目標，在第3回合結束前應該
能擊墜20架，讓黑百合的第二次移動停在目標地點附近，達到20架後直接進入即可獲得SR。
第29話：各自的驕傲
- 勝利條件：1.FTO的HP降至10000以下
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.特急勇者或雷阿斯遭擊墜
- 敵方初期配置：伊法斯ε，亞皮耶斯（3），伊比特α（12），伊比特β（12），伊法斯（3）,FTO，轟龍，史諾比，斯塔克4126，弗洛瑪姬（2），終極音速號8823（2），
- 敵方增援：1.NSX（FTO擊墜後上場），光子戰鬥艦（NSX擊墜或加入我方後上場）
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號+16機，雷阿斯，特急勇者
- 我方增援：轟龍（擊墜後加入我方），NSX（擊墜或5回合後加入我方），特急勇者->無敵勇者
- SR獲得條件：在3回合以內，將HP10000以上的FTO一擊擊墜
一開始讓我方機體削減FTO的血量至11000左右，然後讓滿氣的神威高達一擊擊墜還是可以很容易的達成SR條件，打之前記得保存以防萬一。需要在5回合內擊墜增援的NSX，可以獲得兩個之後非常有用的強化零件，不然NSX劇情變為我方後就無法獲得了。轟龍可以交給無敵勇者來對付，擊墜後同樣會變為我方。接下來就是全滅敵人即可，最後用暴旋霸王及亡靈（如果有出擊的話)分別和伊法斯ε交戰一次然後用暴旋霸王擊墜，這是關係到IF路線能否開啟的條件之一。
路線分歧
- （A） 加入正規部隊：拉-凱拉姆，撫子C，NSX，高達Z小隊，魔神小隊隊，GGG，特急勇者小隊，竹尾通用公司小隊，艾斯特巴厘斯小隊，Top小隊，靈光戰士小隊，魔法騎士小隊
- （B） 加入非正規部隊：阿爾卡迪亞號，骷髏尖兵小隊，鎧甲勇士，高達鬥士小隊，牛仔，蓋特小隊，裝甲騎兵小隊，Arhan，黑百合
此處選擇A路線。
第30話（A）：少年不會回頭
- 勝利條件：1.擊墜亞克托-德卡 2.全滅敵人
- 失敗條件：2.v高達遭擊墜
- 敵方初期配置：亞克托-德卡，基拉-德卡（4）
- 敵方增援：魔像（6），畢亞雷斯(3)，雷普拉甘（9）
- 我方初期配置：v高達
- 我方增援：拉-凱拉姆，撫子C，NSX+15機
- SR獲得條件：3回合以內，擊墜其他敵人，再擊墜亞克托-德卡
第1回合趕路，第2回合削減亞克托-德卡的血量，在敵方回合反擊削減雜兵的血量，第3回合繼續攻擊亞克托=德卡，確保反擊時能夠擊墜。達成SR後增援出現，阿姆羅可以直接沖進去。我方大部隊配合全滅敵人即可過關。
31-40話
第31話(A)：不安與恐懼的前方
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.比爾拜因遭擊墜
- 敵方初期配置：德萊森（2），仁王（2），EI-15（5），包茲（2），魔神（2），佩茲-巴塔斯（2)，加拉傑克多V2（2），亞特拉斯MKII(2)
- 敵方增援：魔像(12)，雷普拉甘（亞連），畢亞雷斯（4）
- 我方初期配置：拉-凱拉姆，撫子C，NSX+15機，比爾拜因
- 我方增援：無
- SR獲得條件：在4回合內通過關卡
沒有難度的一關，還是老樣子分成兩隊，一隊去擊墜第2回合出現的增援，另一隊對付腦核的混編部隊，擊墜雷普拉甘後比爾拜因會強化技能。
第32話(A)：聖戰士飛翔
- 勝利條件：1.擊墜茲瓦烏斯
- 失敗條件：1.薩拜因，比爾拜因遭擊墜
- 敵方初期配置：茲瓦烏斯
- 敵方增援：德拉姆洛（15），雷普拉甘（2），畢亞雷斯（3）
- 我方初期配置：薩拜因
- 我方增援：1.比爾拜因->維爾賓 2.拉-凱拉姆，撫子C，NSX+15機
- SR獲得條件：5回合內過關，過關前ExC曾經到過10
31話結束時強化一下薩拜因，給席翁也學點技能，以免陷入苦戰。第2回合比爾拜因增援，雖然潔麗露會增援出場，但會被換乘維爾賓的翔劇情殺。SR條件有時間限制，之前用掉2回合，因此實際上只有3回合的時間來擊墜敵機積累ExC。注意過關條件是擊墜茲瓦烏斯而不是全滅敵人，覺得時間不夠的，就讓一架機體的ExC到10後直接擊墜Boss過關。32話結束後兩條路線匯合。
第33話：誓願的高達武鬥
- 勝利條件：1.救出阿蓮比 2.由神威高達擊墜諾貝爾高達
- 失敗條件：1.神威高達遭擊墜 2.諾貝爾高達遭擊墜 3.神威高達以外的機體擊墜諾貝爾高達
- 敵方初期配置：諾貝爾高達
- 敵方增援：1.魔像(15) 2.血之搖籃（4），朵拉古魯(6)，魔像(4)，雷普拉甘(10)，雷普拉甘（亞連），雷普拉甘(潔麗露），伊諾巴，
- 我方初期配置：神威高達
- 我方增援：1.海盜高達X1-全覆式披風，撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號，NSX+15機 2.諾貝爾高達（擊墜後變為我方）
- SR獲得條件：一擊擊墜巨型宗師高達
一開始SR條件是隱藏的。但攻擊一次後增援就會出現，讓其他機體削減諾貝爾高達的血量，最後由神威高達給予最後一擊。剩下的機體可以去後方減少雜兵機體的數量。諾貝爾高達變為我方後，敵方增援再一次大量出現。巨型宗師高達血量比較厚，但目前沒有人學會如“熱血”及“魂”等加傷害的精神，如果在第29話擊墜了NSX的話會拿到強化零件“勇者之證”，記得在戰鬥開始前給神威高達裝備上，在攻擊Boss時使用“勇氣”配合“石破天驚拳”，保險一點再讓主角機支援攻擊，達成SR還是比較容易的。
第34話：終焉之日
- 勝利條件：1.全滅敵人 2.擊墜魔神查凱多 3.擊墜魔神艾梅洛德
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2。雷阿斯，瑟雷斯，威達姆遭擊墜
- 敵方初期配置：德拉姆洛（8），畢亞雷斯（4），雷普拉甘（4），茲瓦烏斯
- 敵方增援：1.加拉傑克多V2（10） 2.魔像（8），魔神查凱多 3.魔神艾梅洛德
- 我方初期配置：雷阿斯，瑟雷斯，威達姆，撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號，NSX+15機
- 我方增援：無
- SR獲得條件：在5回合以內擊墜其他所有敵人後擊墜查凱多
雖然一開始看上去敵人不多，但增援出場的魔神查凱多及黑騎士拉邦駕駛的茲瓦烏斯都是血量非常厚的，何況還跟著大量雜兵機，需要讓我方集中攻擊Boss的同時還要減少敵機數量，因此時間還是很緊張的。魔神查凱多會2動，傷害很高，記得使用精神保命。擊墜查凱多後魔神艾梅洛德出現，會3動，但還好只有1架機體，時間限制也沒了，可以慢慢磨血，但因為劇情原因小心血薄的我方3架魔法騎士被擊墜導致關卡失敗。最後3人學會合體技能一下擊墜了魔神艾梅洛德。
路線分歧
- （A） 地面部隊：阿爾卡迪亞號，NSX，高達鬥士小隊，靈光戰士小隊，裝甲騎兵小隊，GGG，特急勇者小隊，竹尾通用公司小隊，鎧甲勇士，魔神小隊，Top小隊，蓋特小隊，魔法騎士小隊，牛仔，Arhan
- （B） 宇宙部隊：拉-凱拉姆，撫子C，骷髏尖兵小隊，黑百合，高達小隊，艾斯特巴厘斯小隊
第35話（A）：無限地獄
- 勝利條件：1.擊墜阿修羅P1 2.全滅敵人
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.無敵鐵金剛，大魔神，雷阿斯，瑟雷斯，威達姆任一遭擊墜
- 敵方初期配置：加拉傑克多V2（16），阿修羅P1，傑瑟J1，
- 敵方增援：1.魔物（16） 2.魔神雷卡利亞，魔物（4)
- 我方初期配置：阿爾卡迪亞號，NSX+12機，無敵鐵金剛，大魔神，雷阿斯，瑟雷斯，威達姆
- 我方增援：魔神蘭迪斯
- SR獲得條件：在3回合內的同一回合中，先擊墜傑瑟J1，再擊墜阿修羅P1
主力機體全在這條路線，因此不用擔心會很難，SR條件也是很容易達成的。擊墜boss後初期敵機會全部撤退，因此先全滅所有雜兵，再擊墜兩架Boss機體。劇情後大魔神離開，無敵鐵金剛撤退，敵方增援出現，注意雷阿斯會直接在敵機群前面，先往後撤和大部隊會合，再擊墜敵機。下回合諾娃會駕駛魔神雷卡利亞作為敵方出場，而且離雷阿斯很近，但魔神蘭迪斯會增援我方，瑟雷斯和威達姆學會新技能，並移動到了雷阿斯附近。
第36話（A）：光子力
- 勝利條件：1.擊墜布羅肯T9 2.擊墜INFINITY
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜
- 敵方初期配置：布羅肯T9，加拉傑克多V2（22）
- 敵方增援：1.朵拉古魯（12） 2.INFINTY
- 我方初期配置：阿爾卡迪亞號，NSX+16機
- 我方增援：無敵鐵金剛
- SR獲得條件：3回合內擊墜所有加拉傑克多V2後，再擊墜布羅肯T9
SR條件沒有什麼難度，第2回合出現敵方增援，不過會攻擊機械獸和我方，雖然和SR的獲得條件無關，有餘力的話還是在擊墜布羅肯前全數擊墜，因為有劇情導致之後所有未被擊墜的敵機消失。擊墜布羅肯拿到SR後我方增援強化的無敵鐵金剛，劇情後敵方出現究極的大魔神INFINITY，INFINITY有地圖兵器，不但傷害非常高，血也很厚，但我方集火攻擊很快就能打掉。結束後大魔神和劍鐵也歸隊，且和無敵鐵金剛有合體技。
36話結束後兩條路線匯合。
第37話：月面激鬥
- 勝利條件：1.全滅敵人 2.擊墜任一原種
- 失敗條件：1.戒特王遭擊墜 2.我方戰艦遭擊墜 3，戒特王或我王凱牙遭擊墜
- 敵方初期配置：1.機界原種（6），El-15（12），金屬獸（10）
- 敵方增援：1.朵拉古魯（12），血之搖籃（8），Saudade of Sunday，Dahlia of Wednesday 2.合體原種(擊墜任何一架原種後）
- 我方初期配置：戒特王
- 我方增援：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號，NSX+16機，我王凱牙
- SR獲得條件：通關前，擊墜40台以上
又是搶人頭的一關，敵機算上boss一共50架，但只要擊墜任何一架原種，剩下的會合體成一個，因此6個原種其實只能算2架擊墜數。再加上敵方之間擊墜的不算，因此敵機數量剛好勉強夠SR條件，這就要看第3方勢力能拿到多少殘血敵機的人頭了。記得隨時查看戰況來確認擊墜數是否足夠。合體原種有地圖兵器，注意別排成一列免得翻車。
第38話：太陽系絕對防衛線
- 勝利條件：1.全滅敵人
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.GunBuster或戒特王遭擊墜 3.迎來第7回合
- 敵方初期配置：宇宙怪獸(49)，宇宙怪獸上陸艇（5)，宇宙怪獸巡洋艦級(3)
- 敵方增援：宇宙怪獸上陸艇（2)，宇宙怪獸（6)，宇宙怪獸巡洋艦級(1)
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號，NSX+16機，戒特王，GunBuster
- 我方增援：無
- SR獲得條件：4回合以內，通過關卡
失敗條件是6回合，而SR條件是4回合，加大了此關的難度，主力機體分散開並朝上陸艇及巡洋艦級移動，路上依靠反擊清理雜兵。給GunBuster裝上恢復en的強化零件，免得續航能力不夠無法輸出。地圖兵器和“多重行動”在這關有非常大的作用，就算範圍內有我方機體，給那個機體上個“預見”精神或者移動位置即可。劇情後GunBuster變成2人機體，也強化了技能，對付增援的敵方完全沒問題。
第39話：沉睡的光明，覺醒的黑暗
- 勝利條件：1.全滅敵人
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.無敵勇者，超龍神，擊龍神遭擊墜
- 敵方初期配置：巴塔斯（12），佩茲-巴塔斯（4），康古裡久（2）
- 敵方增援：1.亞皮耶斯(2），伊比特α（4)，伊比特β((4），伊法斯（2），帝王號，埃克斯（4），伊普瑟隆（3），光子戰鬥艦，夜天光，六連（2），杜班-烏爾夫，斯塔克4126，史諾比 2.黑暗要塞（帝王號擊墜後出場）
- 我方初期配置：擊龍神，超龍神，無敵勇者，撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號，NSX+16機
- 我方增援：無
- SR獲得條件：2回合內全滅敵人
沒有難度的SR，此關的難點在後面。小心萬年板凳機體擊龍神和超龍神別不小心被擊墜。可以的話最好讓他們躲進戰艦內。2回合將初期敵人全滅後獲得SR，敵方出現大量增援和Boss.儘快將帝王號擊墜，不然一定回合後黑暗要塞會替代他出場，經驗和資金都會無法獲得。光子戰鬥艦會盯著阿爾卡迪亞號，夜天光會盯著黑百合（如果有出擊的話），打掉黑暗要塞一半血量後有劇情，無敵勇者學會雙重動輪劍，超龍神和擊龍神學會合體技能。但還是需要讓兩個龍神往後撤退，黑暗要塞的地圖兵器很i強力,血量少的機體就別上去了，就算上前也要提前上好精神來回避地圖兵器的攻擊。
第40話：真龍翱翔
- 勝利條件：1.全滅敵人
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.真蓋特遭擊墜
- 敵方初期配置：機界原種(6)，金屬獸（10）
- 敵方增援：1.侵略者（海星）（16） 2.真蓋特飛龍 3.侵略者（昆蟲）（2），侵略者（烏賊）（2）
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號，NSX+16機，真蓋特
- 我方增援：真蓋特->真蓋特飛龍
- SR獲得條件：在一次戰鬥中擊墜任一原種
原種血量不多，因此SR還是很容易拿到的。擊墜任何一架機界原種後會出現增援，擊墜真蓋特飛龍後龍馬等人會換乘人形的真蓋特飛龍，擊墜剩下的敵機即可過關。
41-50話
第41話：大家的幸福
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜
- 敵方初期配置：1.薩克III改，薩克III（2），德萊森（6），茲沙（8) ，亞克托-德卡（紅），亞克托-德卡（綠），基拉-德卡（蕾森），基拉-德卡（6），佩茲-巴塔斯（4),巴塔斯（6），康古裡久（2）
- 敵方增援：Dahlia of Wednesday，朵拉古魯（12）
- 我方初期配置：撫子C，阿爾卡迪亞號，NSX，拉-凱拉姆+16機
- 我方增援：Dann of Thursday
- SR獲得條件：在3回合以內，擊墜薩克III改，亞克托-德卡（紅），亞克托-德卡（綠），基拉-德卡（蕾森）
如果想要夏亞小隊和哈曼小隊加入的話，這關一定要讓卡繆，捷多，阿姆羅及花出擊。並且合理安排好出擊位置，可以節約不少時間，花需要與瑪修瑪交戰一次，然後再擊墜。注意增援的敵軍和夏亞，哈曼軍是對立的，因此別被搶人頭了，Saudade of Sunday會被Dann劇情殺。Dann學會最強的技能。得到SR後可以放心的擊墜剩下的敵機了。
第42話：被託付的意志
- 勝利條件：擊墜亞皮耶斯-亞特
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.暴旋霸王遭擊墜
- 敵方初期配置：亞皮耶斯-亞特，亞皮耶斯（5），伊法斯（5），伊比特α（10），伊比特β（10）
- 敵方增援：亞皮耶斯（2），伊法斯（2），伊比特α（4），伊比特β（4）
- 我方初期配置：撫子C，阿爾卡迪亞號，NSX，拉-凱拉姆+16機，暴旋霸王
- 我方增援：無
- SR獲得條件：在4回合以內，擊墜所有敵人，再擊墜亞皮耶斯-亞特
一開始敵機是包圍我方的，需要派幾架機體專門去擊墜，其他主力機體向Boss機體靠近，削減血量，順便擊墜雜兵機體累計Exc，方便我方使用”多重行動“。擊墜一定數量敵機後，敵方會再出現一批增援。此關敵人密集，用大範圍的地圖兵器可以清場。最後暴旋霸王學會最強技能。清理完雜兵後擊墜Boss獲得SR，注意用主角機體來擊墜Boss，是能否開啟IF路線的條件之一。
路線分歧
此處分歧只有劇情區別，我方不會分開隊伍。路線分為：
- （A） 與夏亞合作
- （B） 與哈曼合作
- （C） 繼續獨自作戰
第43話（C）：混沌宇宙
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：我方戰艦遭擊墜
- 敵方初期配置：1.薩克III（2），德萊森（6），茲沙（8） 2.基拉-德卡（蕾森），基拉-德卡（5），康古裡久（2），佩茲-巴塔斯（3），巴塔斯（6）
- 敵方增援：薩克III改，基拉-德卡（裘尼），基拉-德卡（葵絲），.薩克III（2），德萊森（4），茲沙（4），基拉-德卡（6），康古裡久（2），佩茲-巴塔斯（2），巴塔斯（4）
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號，NSX+16機
- 我方增援：無
- SR獲得條件：在3回合內，全滅敵人
本關卡請一定讓梅塔斯，Z高達，v高達和ZZ高達出擊，用相應人物擊墜對應的Boss是隱藏要素相關，影響哈曼小隊和夏亞小隊是否加入。出擊時分配好位置，確保距離最近出現的雙方是互相敵對的，我方大部隊分成兩邊進攻可以很快的拿到SR。初期敵人全滅後敵方增援出現，這次是兩軍聯手了，全滅敵人後過關。
第44話（C）：沉默之聲
- 勝利條件：1.在4回合內擊墜丘貝雷
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.丘貝雷遭擊墜
- 敵方初期配置：丘貝雷，姆薩卡（7），杜班-烏爾夫（2），基拉-德卡（10），德萊森（6），薩克III（4），康古裡久（2），佩茲-巴塔斯（4），巴塔斯（8）
- 敵方增援：Sin of Friday，死亡軍團（8），巨型宗師高達（2），朵拉古魯（10）
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號，NSX+16機
- 我方增援：丘貝雷（擊墜後加入我方）
- SR獲得條件：在4回合內，擊墜所有其他敵人後再擊墜丘貝雷。
獲得SR的難點在於後方的戰艦數量比較多，血也厚，而且一開始不會行動，移動力高的機體快速沖向戰艦，削減血量，後方腿短的機體清理雜兵，最後用捷多來擊墜哈曼，影響哈曼小隊是否加入。擊墜丘貝雷後敵方增援，哈曼變為我方，但丘貝雷血很少，還是不要衝上去。
第45話（C）：墜落的紅色彗星
- 勝利條件：1.全滅敵人 2.擊墜夜鶯
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.v高達或宗師高達遭擊墜
- 敵方初期配置：留露拉號（6），α-阿基爾，昆曼沙，杜班-烏爾夫（8），，姆薩卡（6），基拉-德卡（16），康古裡久（8）
- 敵方增援：1.沙薩比 2.夜鶯，伊法斯ξ（4）
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號，NSX+16機，v高達
- 我方增援：1.v高達->Hi-v高達 2.宗師高達
- SR獲得條件：在4回合以內，擊墜昆曼沙，α-阿基爾，留露拉號，姆薩卡後再擊墜沙薩比
一開始SR條件是隱藏的，第2回合夏亞出現，SR條件也變更了，總體來說不難，但夏亞傷害高，還會2次行動，因此小心我方血少的機體被秒。提前給阿姆羅上好精神，因為只要一接近，夏亞就會盯著阿姆羅打。擊墜夏亞後，阿姆羅換成Hi-v高達，夏亞換乘夜鶯，敵方也出現增援，我方則有東方不敗出場，用宗師高達擊墜1架以上的機體，關係到宗師高達能否提早加入。全滅敵人後再擊墜夜鶯。
45話結束後繼續共通路線。
第46話：鬥志于冰原燃燒
- 勝利條件：1.擊墜亞皮耶斯-亞特
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.神威高達或黑百合遭擊墜
- 敵方初期配置：亞皮耶斯-亞特，亞皮耶斯（3），伊法斯（12），血之搖籃（8）
- 敵方增援：1阿修羅P1，加拉傑克多V2 2.魔神雷卡利亞，魔物（8） 3.惡魔高達 4.宗師高達（戰鬥結束後變為敵方）
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號，NSX+16機，神威高達，黑百合
- 我方增援：1.宗師高達 2.神威高達（和宗師高達單挑）
- SR獲得條件：在4回合以內擊墜所有亞皮耶斯，伊法斯，並用“粉碎猛擊”擊墜亞皮耶斯-亞特
SR並不難，但需要留幾架主力機體在左右兩邊，其餘的往Boss處移動，因為一會會有敵人出現。魔神雷卡利亞會盯著魔法騎士相關的機體打，阿修羅P1則會盯著大魔神或者無敵鐵金剛。讓暴旋霸王累計Exc，然後最後一擊擊墜亞皮耶斯-亞特前使用“粉碎猛擊”，關係到能否進入IF路線的條件之一。擊墜亞皮耶斯-亞特後，惡魔高達出現，我方也有宗師高達增援，用宗師高達和惡魔高達至少交戰一次再進行擊墜。最後是多蒙和東方不敗的單挑，有改造過神威高達的話，只要“粉碎猛擊”+“魂”就可以一擊必殺。
第47話：鋼鐵的7人
- 勝利條件：1.全滅敵人 2.擊墜天草（生化腦）3.擊墜迪比尼達德
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.丘貝雷，海盜高達X1-全覆式披風，海盜高達X1改-改，Z高達，全裝甲型ZZ高達，Hi-v高達任一遭擊墜 3.迎來第8回合
- 敵方初期配置：康古裡久（7），佩茲-巴塔斯（21）
- 敵方增援：1.天草（生化腦），天草（20） 2.迪比尼達德（7）
- 我方初期配置：丘貝雷，海盜高達X1-全覆式披風，海盜高達X1改-改，Z高達，全裝甲型ZZ高達，Hi-v高達，撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號，NSX+12機
- 我方增援：夜鶯
- SR獲得條件：在5回合內擊墜所有敵人，通過關卡
最讓人激動的一關，曾經的敵人變成我方並且攜手合作對敵。我方失敗條件的機體很多，沒改造過的話需要注意血量，也不要在敵方回合觸發劇情，必要時後援指令也用上，擊墜5架敵機後敵方大量天草增援，我方有夏亞增援，其中有兩架血厚的生化腦是勝利條件，擊墜生化腦後7架迪比尼達德出現，我方宗師高達會在擊墜2架後增援。
這關需要用到地圖兵器清場，不然時間肯定不夠，“決心”+“行動恢復”也是必要的，畢竟後面出現的敵機都是血量高的，而留給我方的時間不多，SR的時間更加短。此關通過後如達成了宗師高達的加入條件，東方不敗會提早加入，否則會在選擇了IF路線的第52話才會加入。夏亞和哈曼如沒達成加入條件，則會在此關增援。但不會加入隊伍。
第48話：期盼絕望之人
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：我方戰艦遭擊墜
- 敵方初期配置：宇宙怪獸巡洋艦級（5），宇宙怪獸上陸艇（6），宇宙怪獸兵團（24），侵略者（海星）（20），侵略者(烏賊）（2），侵略者（昆蟲）(2)，機界原種（4）
- 敵方增援：魔神雷卡利亞
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號，NSX+20機
- 我方增援：無
- SR獲得條件：在3回合以內通過關卡
我方一開始的出擊位置是以4架戰艦為中心分散的，將主力機體放在前方面對巡洋艦級，在週邊放上有遠距離武器的機體，例如v高達的浮游炮等來方便我方反擊。擊墜20架敵機後魔神雷卡利亞出現，還是一樣會優先盯著魔法騎士。我方一開始就是滿氣的，因此只要先將血厚的敵方優先打掉，剩下的時間完全可以清理雜兵。
第49話：前往無限延申的未來
- 勝利條件：1.擊墜茲瓦烏斯和魔神雷卡利亞 2.擊墜蒂波尼雅
- 失敗條件：1我方戰艦遭擊墜 2.雷阿斯，瑟雷斯，威達姆，NSX遭擊墜
- 敵方初期配置：魔神雷卡利亞，茲瓦烏斯，魔物（16），雷普拉甘（4），畢亞雷斯（4）
- 敵方增援：蒂波尼雅
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號，NSX+16機，雷阿斯，瑟雷斯，威達姆
- 我方增援：魔神蘭迪斯
- SR獲得條件：在3回合以內，擊墜其他敵人並達成勝利條件
敵機數量不多，因此SR比較簡單，但茲瓦烏斯在血量低的時候會使用“必中”“不屈”和“熱血”，先用非主力機體消耗掉再用主力機體攻擊。達成SR後蒂波尼雅出現，注意Boss的攻擊會讓我方出現“無法行動“的狀態，這情況下再吃一發地圖兵器是很危險的，因此不要用”不屈“而是用”閃身“或者”預見“來回避。打掉Boss一半血後小光會學會”心願“，效果類似前作的”教條，任一機體“魂”+“氣魄”+“直截攻擊”+“粉碎猛擊”。Boss的地圖兵器盲點在距離1，3，7格處。
第50話：看不見的神之意志
- 勝利條件：全滅敵人
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.眼鏡鬥犬，新型Arhan遭擊墜
- 敵方初期配置：亞皮耶斯-亞特，亞皮耶斯（3），艾克魯比斯，法提（6），眼鏡鬥犬（3），伊法斯（6），伊比特Ω（18）
- 敵方增援：1.光子戰鬥艦 2.布羅肯J1.加拉傑克多V2（6） 3.地上戰艦（6）
- 我方初期配置：撫子B，拉-凱拉姆，阿爾卡迪亞號，NSX+18機，眼鏡鬥犬，新型Arhan
- 我方增援：無
- SR獲得條件：5回合內過關，過關前任一駕駛員Exc到達10
SR條件中Exc點數要求很簡單，有“決心”精神的連用兩次即可完成，至於在時間限制內全滅敵機，相信打到這關了的機體都不會很差，只要優先將出現的Boss機擊墜就完全不是問題。一定回合後光子戰鬥艦作為敵方增援，但會擊墜亞皮耶斯-亞特。右方出現布羅肯和雜兵機械獸，右上角出現6架地上戰艦比較遠，用“加速”和“推進衝刺”可以快速趕過去。
路線分歧
接下來是結局路線選擇：
- （A）逐一打倒眼前的敵人：普通結局
- （B）就算艱難，也要積極作戰：IF路線結局
IF路線開啟條件：
- 第50話時ACE≥25，GRADE為6級
- 第8話，第26話，第29話以主角機擊墜露迪，在第46話以主角機擊墜瓦西魯蒙
51話-最終話
第51話（A）：燕尾服在明日舞動
- 勝利條件：1.擊墜惡魔高達，Saudade of Sunday，Dahlia of Wednesday
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.神威高達，伯魯凱因改，Dann of Thursday遭擊墜
- 敵方初期配置：惡魔高達，死亡軍團（8），血之搖籃（10），朵拉古魯（12）
- 敵方增援：1.Saudade of Sunday，Dahlia of Wednesday 2.Birthday，巨型宗師高達（4）
- 我方初期配置：撫子C，阿爾卡迪亞號，NSX，拉-凱拉姆+21機，神威高達，伯魯凱因改
- 我方增援：Dann of Thursday
- SR獲得條件：在3回合以內，讓勾爪男的機體登場
惡魔高達HP低於一半（5萬左右）時會有劇情，因此最好配合精神擊墜一次，不然少拿很多資金和經驗。Dann增援，後援蕾茵回歸。要達成SR條件需要在3回合內擊墜惡魔高達，Saudade of Sunday，Dahlia of Wednesday。注意兩架鎧甲Boss只要擊墜其中之一，另一架就會給自己上精神，還是先用機體消耗掉再攻擊。擊墜後Boss機體-Birthday登場，SR條件達成。Boss機有18w4000的血，但集火攻擊還是很快能擊墜的，注意地圖兵器的範圍，提前給範圍內的機體上好“不屈”和回避精神。
第51話（B）：夢與復仇的終點
- 勝利條件：1.全滅敵人 2.擊墜Saudade of Sunday和Dahlia of Wednesday 3.擊墜Birthday
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.神威高達，Dann，伯魯凱因改遭擊墜 3.迎來第8回合
- 敵方初期配置：伊法斯（5），伊比特Ω（15）
- 敵方增援：1.惡魔高達（5），朵拉古魯（16），Saudade of Sunday，Dahlia of Wednesday 2.Birthday
- 我方初期配置：撫子C，阿爾卡迪亞號，NSX，拉-凱拉姆+21機，神威高達，Dann，伯魯凱因改
- 我方增援：無
- SR獲得條件：在2回合內擊墜15架以上敵機
SR條件只要配合好精神的話沒有難度，前面打得快的話可以省下很多時間。只要打倒15架後敵機就會劇情全滅，然後敵方增援出現。因此想多賺點錢的話就用地圖兵器清場。Saudade of Sunday和Dahlia of Wednesday只要擊墜其中之一，便會給自己上精神。用非主力機體消耗掉再攻擊。擊墜兩個Boss後Birthday出現，小心他的地圖兵器，集火擊墜即可過關。
第52話（A）：無限之光
- 勝利條件：1.擊墜阿修羅P1和布羅肯T9
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.無敵鐵金剛遭擊墜
- 敵方初期配置：屠殺者，傑瑟，達姆達姆，阿修羅P1，布羅肯T9，加拉傑克多V2（18）
- 敵方增援：1.伊法斯（3），伊比特Ω（12） 2.INFINTY 3.屠殺者，傑瑟，達姆達姆(INFINTY的HP低於一半前每回合出現一次）
- 我方初期配置：撫子C，阿爾卡迪亞號，NSX，拉-凱拉姆+23機，無敵鐵金剛
- 我方增援：無
- SR獲得條件：在3回合以內先擊墜所有機械獸，再擊墜阿修羅P1和布羅肯T9
機械獸除了後面幾隻血量厚以外，數量不多，因此SR條件還是很容易的。有餘力的可以擊墜增援的敵人，但和SR條件無關。INFINTY會在達成SR條件後出現，並擊墜所有伊法斯和伊比特Ω，並且每回合會召喚出屠殺者，傑瑟，達姆達姆直到Boss的HP低於一半發生劇情，無敵鐵金剛學會新技能。只要注意Boss的地圖兵器，其他沒難度。
第52話（B）：超越可能性
- 勝利條件：1.擊墜惡魔高達 2.擊墜布羅肯T9，阿修羅P1
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.神威高達，無敵鐵金剛遭擊墜 3.迎來第7回合
- 敵方初期配置：惡魔高達，巨型宗師高達（4），死亡軍團（16）
- 敵方增援：布羅肯T9，阿修羅P1，加拉傑克多V2（15） 2.INFINTY，屠殺者，傑瑟，達姆達姆(每回合出現一次）
- 我方初期配置：撫子C，阿爾卡迪亞號，NSX，拉-凱拉姆+23機，神威高達，無敵鐵金剛
- 我方增援：無
- SR獲得條件：在5回合內通過關卡。
惡魔高達HP低於一半（5萬左右）時會有劇情，因此最好配合精神擊墜一次。面對惡魔高達的同時，還要派機體到左側，敵方增援一出來就可以立刻攻擊。惡魔高達還要再擊墜一次，擊墜布羅肯T9，阿修羅P1後INFINTY出現，每回合會召喚一次屠殺者，傑瑟，達姆達姆。打到一半會有劇情，無敵鐵金剛學會新技能。集火攻擊INFINTY，不要管出來的機械獸了。
第53話（A）：激戰的結果
- 勝利條件：1.全滅敵人 2.擊墜柯文&史提卡，合體原種 3.擊墜Z主腦
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.Z主腦出現後經過5回合
- 敵方初期配置：宇宙怪獸混合型(2)，宇宙怪獸巡洋艦級(4)，宇宙怪獸上陸艇(8)，宇宙怪獸兵隊(32)
- 敵方增援：1.侵略者（烏賊）（2），侵略者（昆蟲）（2），侵略者（沙蟲）（2)，柯文&史提卡，合體原種
- 我方初期配置：撫子C，阿爾卡迪亞號，NSX，拉-凱拉姆+23機
- 我方增援：無
- SR獲得條件：在3回合內擊墜柯文&史提卡，合體原種
如果不去管雜兵的話，3回合時間還是很足夠的，讓主力機體前往兩側等待Boss出現，剩下的往前沖。為了不在接下來的Boss戰浪費時間，還是需要清理雜兵的。Z主腦HP低於一半時有劇情，我方全員恢復，擊墜Boss即可。
第53話（B）：門在激戰過後開啟
- 勝利條件：1.全滅敵人 2.擊墜柯文&史提卡，合體原種 3.擊墜Z主腦 4.擊墜新界原種，除戰艦和我王凱牙外，只要與之戰鬥不論結果如何都會撤退
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.Z主腦出現後經過5回合
- 敵方初期配置：宇宙怪獸混合型(2)，宇宙怪獸巡洋艦級(4)，宇宙怪獸上陸艇(8)，宇宙怪獸兵隊(32)
- 敵方增援：1.侵略者（烏賊）（2），侵略者（昆蟲）（2），侵略者（沙蟲）（2)，柯文&史提卡，合體原種 2.宇宙怪獸混合型，宇宙怪獸巡洋艦級(2)，宇宙怪獸上陸艇(4)，宇宙怪獸兵隊(16)
- 我方初期配置：撫子C，阿爾卡迪亞號，NSX，拉-凱拉姆+24機
- 我方增援：無
- SR獲得條件：在3回合內擊墜柯文&史提卡，合體原種
一開始的出擊位置和48話是一樣的，主力在前方，後方交給其他機體對付。擊墜一定數量敵機後右上角出現柯文&史提卡，左上角出現合體原種。讓主力機體分開左右後在時間限制內擊墜。隨後敵方增援再次出現，我方露迪會加入後援。隨後Z主腦出現，將其HP降到一半時發生劇情，我方全員恢復。擊墜Z主腦後新界原種出現，敵方剩下的機體全滅。由於我方除了我王凱牙和戰艦外，攻擊一次都會撤退，可以的話先讓主力機體躲進戰艦內，撐過一輪敵方回合後再出擊集火攻擊。不然新界原種行動時將主力全都打撤退了就打不過去了。
最終話（A）：給地球未來，給戰士祝福
前半：
- 勝利條件：擊墜亞魯歐魯及伊法斯Ω
- 失敗條件：我方戰艦遭擊墜
- 敵方初期配置：亞魯歐魯，杜班-烏爾夫（拉坎），雷普拉甘（亞連），雷普拉甘（潔麗露），夜天光，漢謨拉比，伊法斯Ω，亞皮耶斯-亞特（2），亞皮耶斯（6），伊法斯ε（4），伊法斯（12），伊比特Ω（24）
- 敵方增援：無
- 我方初期配置：撫子C，阿爾卡迪亞號，NSX，拉-凱拉姆+24機
- 我方增援：無
- SR獲得條件：本關無SR
最終關卡的前半部分，本場戰鬥我王凱牙的最終武器及命的後援指令都是無法使用的。由於並沒有SR點數，因此可以布好陣型等敵人慢慢送過來打。沒有難度的一關。
後半：
- 勝利條件：1.擊墜新界原種，除戰艦和我王凱牙外，只要與之戰鬥不論結果如何都會撤退 2.擊墜達蓋安
- 失敗條件：1.我方戰艦遭擊墜 2.迎來第4回合
- 敵方初期配置：亞魯歐魯，杜班-烏爾夫（拉坎），雷普拉甘（亞連），夜天光，雷普拉甘（潔麗露），漢謨拉比，亞皮耶斯-亞特，亞皮耶斯，伊法斯Ω，伊法斯，伊比特Ω
- 敵方增援：達蓋安，提朗特（40）
- 我方初期配置：撫子C，阿爾卡迪亞號，NSX，拉-凱拉姆+24機
- 我方增援：無
- SR獲得條件：本關無SR
一開始敵人只有新界原種一架，雖然我方全員半血，但SP是滿的，為了不影響後面的戰鬥，只能讓我王凱牙和戰艦攻擊，使用阿爾卡迪亞號的“海盜戰法”讓我方戰艦可以移動後攻擊。配合加攻擊力的精神爭取第1回合的我方行動階段就將112000血的新界原種打倒，千萬別進入敵方回合。擊墜後真正的反派Boss出現，直接將好基友砍了。
敵人雜兵眾多，Boss機體雖然只有一個單體武器和一個地圖兵器，但非常強力，而且每回合敵方階段開始時還會隨機對我方4架機體炮擊造成傷害。讓血少的機體躲進戰艦。先清理雜兵，等他們集合到一起時用地圖兵器清場。將達蓋安打掉四分之一時有劇情，達蓋安的氣力直接降到50，無法使用地圖兵器，我方全員恢復滿SP，因此全力攻擊吧！精神等就不用節約了。
最終話（B）：船將前往希望的大海
前半：
- 勝利條件：擊墜亞魯歐魯及伊法斯Ω
- 失敗條件：我方戰艦遭擊墜
- 敵方初期配置：亞魯歐魯，杜班-烏爾夫（拉坎），雷普拉甘（亞連），夜天光，雷普拉甘（潔麗露），漢謨拉比，亞皮耶斯-亞特，亞皮耶斯，伊法斯Ω，伊法斯，伊比特Ω
- 敵方增援：無
- 我方初期配置：撫子C，阿爾卡迪亞號，NSX，拉-凱拉姆+24機
- 我方增援：無
- SR獲得條件：本關無SR
最終關卡的前半部分，由於並沒有SR點數，因此可以布好陣型等敵人慢慢送過來打。沒有什麼難度。
後半：
- 勝利條件：1.擊墜達蓋安2號 2.擊墜達蓋安
- 失敗條件：我方戰艦遭擊墜 2.我方行動階段開始時關卡中的敵人單位在30架以上。
- 敵方初期配置：達蓋安，提朗特（28）
- 敵方增援：達蓋安2號機，提朗特（3）（每回合增援數+3）
- 我方初期配置：撫子C，阿爾卡迪亞號，NSX，拉-凱拉姆+24機
- 我方增援：無
- SR獲得條件：本關無SR
一開始真正的反派Boss駕駛達蓋安將好基友砍了，敵人雜兵眾多，Boss機體雖然只有一個單體武器和一個地圖兵器，但非常強力，每回合敵方階段開始時還會隨機對我方4架機體炮擊造成傷害，除此之外，每過一回合就會多增援3架提朗特，而我方行動時敵方機體數超過30架就輸了，因此要一邊削減boss血量，同時也要快速清理雜兵，將其壓制在一定數量以下。將Boss機體HP打掉四分之一後，好基友開著達蓋安2號出現，並且每回合會為達蓋安恢復滿HP。需要優先集火擊墜2號機再攻擊達蓋安，期間要撐過達蓋安的地圖兵器和數量眾多的提朗特的攻擊，會是很艱苦的一戰。
這裡有個好方法，讓我方多架血厚的機體配合減傷的精神，站在敵方雜兵聚集的位置，Boss機會用地圖兵器朝該方向攻擊幫忙清理雜兵。只要擊墜2號後就可以稍微松一口氣，但時間還是別拖太久，不然還是會達到失敗條件。