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在本作中，玩家可以直觀地看到出現在草叢中的野生寶可夢以及它們各式各樣的行為。從它們個性十足的動作中，玩家還可以觀察它們的生態和生活方式。
當看到想要捕捉的寶可夢出現時，你首先要做的就是去接近它。在接觸到野生寶可夢後，你便獲得了面對面捕捉它的機會。
準備好精靈球後，就用它瞄準野生寶可夢投過去吧。
由於野生寶可夢會威嚇你或者動來動去，你需要在掌握好時機的基礎上投擲精靈球。
通過揮動“Joy-Con™”投擲精靈球，在操作順利時便可捉到寶可夢。通過這種體感型控制模式，你可以瞄準寶可夢移動的方向投擲精靈球，從而親身體驗成為寶可夢訓練家的感覺（在“便攜模式”下玩遊戲時，需要先移動畫面瞄準寶可夢，然後按下A鍵投擲精靈球）。
如果精靈球擊中的位置和時機合適，就更有可能成功捕捉到野生寶可夢。
向會動的圓圈內部投擲精靈球可以更容易捉到野生寶可夢；如果在圓圈變小時擊中圓圈，就更容易捕捉成功。試著以會動的圓圈為准心投球吧。
另外，當圓圈的顏色為綠色時就表示容易捕捉；紅色則表示不容易捕捉。
如果精靈球停止搖動，就表示你成功捕捉到寶可夢了。第一次捕捉到的寶可夢將會被添加到寶可夢圖鑒中。
不僅如此，捉到野生寶可夢後，同行寶可夢還會獲得經驗值。當經驗值累積到一定程度後，寶可夢的等級就會提升。等級提升得越高，寶可夢的能力也就越強，有時還可以學會新的招式。
怎樣能讓寶可夢變得更容易捕捉呢？
通過更換精靈球的種類或者使用“樹果”，就可以讓野生寶可夢變得更容易捕捉。
在雙人模式下遊玩可以更容易捉到寶可夢
在雙人模式下，2位元元玩家配合好時機投擲精靈球，就能提高捉到寶可夢的成功率。
即使遇到野生寶可夢之前沒有使用雙人模式，在捕捉畫面揮動另一邊的手柄，也能叫出幫手訓練家。
在絕妙的時機下投球，不但能更容易捕捉成功，同行寶可夢還能獲得更多的經驗值。
精靈球用完了怎麼辦？
除了可以去城鎮中的友好商店購買，你還能通過和寶可夢訓練家對戰來獲得精靈球。
在得到道館徽章後，能在友好商店購買的道具種類也會增加。這時你便可以買到更容易捉到寶可夢的精靈球了。