作者：__expcqr
來源：【遊俠攻略組】
| 序章 |
序章過長CG介紹了刺客組織與聖殿騎士的恩怨，刺客和聖殿騎士們都掌握了通過祖先的記憶回到過去瞭解歷史真相的科技，聖殿騎士們相信最純正的歷史，當他們發現歷史不是他們原本想像的那樣之時，便會用一些極端的手段將歷史推上正軌，刺客們則要阻止他們的這些行為。 然而，一個比聖殿騎士與刺客組織都要可怕的威脅正在逼近。 主角Desmond登場。 主角一行人收到指引來到遺跡。 本關屬於基礎教學，只要按照螢幕提示的操作完成任務即可。
| Sequence 1 |
通過了同步等級測試（即序幕的練習場景），先祖記憶的世界開始建立，主角將依附在先祖身上，揭開聖殿騎士想從主角祖先身上得到的秘密。 場景切換到1754年的倫敦，玩家扮演Haytham kenway，正在前往劇院的路途中。 在劇院中與Reginald對話後，開啟鷹眼，發現目標此時正藏匿在最高處的包廂中。 離開座位，通過樓梯爬到劇院的第二層包廂的外圍，在沿著外圍一路往上爬到盡頭，翻到劇場上方的入口，發現門已上鎖，使用按住左搖桿與右搖桿調整撬鎖的位置，再按下RT鍵將門鎖撬開。 再跳到太陽掛飾上，會落下一段高度，翻到旁邊的平臺，在跳到月亮掛飾上，通過牆壁攀爬目標包廂外的走廊，開門進入。 對話後按下X鍵將其殺害，取下他脖子上的一枚銅幣後離開。
女僕進入貴賓室後發現屍體，劇場內一片混亂，主角很淡定地走到大門離開，門外有馬車的接應。 帶著得到的銅幣來到刺客組織，組織者認為銅幣是一枚鑰匙，能打開的門背後一定藏有不為人知的秘密，並且肯定聖殿騎士此刻也在尋找這一切。 具體地點未知，主角的當前任務便是前往美國鎖定目標，搶在對手之前找到答案。
組織早為Kenway安排了船隻，橫穿大西洋前往美國。 第二天Kenway與船長打招呼，可是當時平民與貴族間的關係並不友好，Kenway受到了船長和船員的排斥。 在甲板上與船員一夥人發生衝突，開始了簡單的戰鬥教學，首先是空手戰鬥的時候按住B鍵不放能彈開所有攻擊，之後使用X能發動三連擊。 第二回合戰鬥的時候利在對手攻擊的瞬間按下B鍵進入子彈時間，可以使用X的連擊將對手擊倒在地。 船員最後不但不屈服還拔刀相向，被主角使用B鍵格擋後A鍵奪刀制服。 船長趕到現場，訓斥了在場所有人，拒絕聽主角的解釋。 跟隨船長到船長室，主角終於使出了看家本領，警告船長“不准再威脅他”，隨後回到自己的房間休息，不悅的旅程才剛剛開始。
出海28天后，Kenway正在船艙研究銅幣的秘密的時候，船長告訴Kenway最近船上有奇怪的流言，讓Kenway自己去搞清楚到底怎麼回事。 Kenway來到倉庫前，找到船員。 船員表示需要小道消息的話找醫生或者廚師比較合適。 與醫生或者廚師任意一人對話，再去船艙找James，James帶著主角來到甲板上，James告訴主角Mills在散播此次航行兇險的消息並且勸船員們離開，最後James表示自己也不知道消息準不准確只希望安全到達彼岸。 來到船舵邊，與舵手對話，聽到有異常的聲音。 回到船艙開啟鷹眼，發掘倉庫裡的酒桶上有異常信息，調查後Kenway明白過來有人在向外界傳遞消息，很可能目標就是自己。 調查完畢後，回到自己的房間休息。 第二天，Kenway來到甲板，告訴船長留意點James與Mills倆人，正在爭執的時候船隻遭到了攻擊，船長讓Kenway回到船艙，剛下船艙，Kenway就遇到了Mills，原來Mills早猜到了一切，並且決定出賣Kenway得到榮耀。 Kenway建議決鬥，Mills接受挑戰並且順利被幹掉（悲劇）。 來到甲板，告訴船長敵船的目標，並且使用手段使得船長屈服，決定冒著風暴的威脅繼續前進。
在風暴中，船體受到損害，需要緊急修復。 主角將協助船長將被閃電燒壞的繩子全部弄斷，之後通過桅杆爬到船的船帆上把被風吹捲成一團的風帆解開。 解開風帆後，在另外一側的船帆受到了閃電的攻擊，正在維修的James被懸掛在空中。 主角救下James，回到甲板，回頭看見背後追著的敵船逐漸沉沒到海中。 出海72天后，船長告訴Kenway到新大陸了。 爬上桅杆的最高處，視線穿透濃霧，看見了遊戲的主舞臺—美國。
| Sequence 2 |
1754年，Kenway到達波士頓，查理斯.李熱情接待了他。 Kenway身上有四封信件，並且主角無法離開Kenway記憶的地點太遠，只能在查理斯一定範圍內移動，在前往武器店的路上能夠送出一封信件。 在武器店門口，二人遇見了因為筆記被偷而苦惱不已的本傑明.富蘭克林，富蘭克林委託Kenway幫忙他找回丟失的筆記，之後在道具店能夠找到富蘭克林。 武器店旁邊能送出第三封信件。 進入武器店，購買刺劍和火藥槍。 再來到武器店旁邊，騎上馬，與查理斯一同前往旅館，在前往旅館的路上能送出最後一封信件，最後達到旅館門口，下馬後能送出最後一封信。 進入旅館，完成到達波士頓的第一個任務。
來到旅館二樓，見到威廉姆斯爵士（Sir William Johnson），Kenway希望得到他的幫助找到門的下落。 威廉姆斯爵士表示自己的研究被偷了，此時無法為他們提供幫助，於是Kenway喊上查理斯一起去為他找回爵士的研究。 離開旅館，在旅館門外與爵士的同行者湯姆斯.希基（Thomas Hickey）對話，三人前往Countyard取回爵士的東西。 使用Y鍵擊斃站崗的士兵開始戰鬥，湯姆斯與查理斯需要等待Kenway開槍才開始戰鬥，消滅掉大門邊與練習射靶的士兵後，在院子門口觸發劇情。 剩餘的竊賊逃入了院子裡，並且關閉了大門。 按住LT鍵移動準星使用火藥槍將油桶點燃，可以炸掉大門。 進入地上能撿到威廉姆斯爵士被偷的箱子，之前的三個竊賊返回，交戰後竊賊頭目告訴Kenway是一群之前沒有見過的人交給他們的任務，Kenway放走了竊賊頭目以警告聖殿騎士。 三人返回，湯姆斯此時的態度友好了許多，在返回的路上會遇到士兵的追擊和埋伏，注意不能離隊友太遠，也不能讓他們的血量低於百分之五十，到達馬車並且將埋伏在馬車周圍的英軍全部消滅後任務完成。 把箱子還給爵士，爵士看過銅幣護身符後覺得上面的圖案似曾相似，在與印第安部落交易的時候見過，但是需要一定時間整理資料才能找出答案，他會在旅館停留一段時間。 （暫時空缺富蘭克林的筆記任務）
第二天醒來，爵士告訴Kenway想要找到答案，需要先找到一個叫本傑明.丘奇（Benjamin Church）的人。 在旅館門口與查理斯對話，前往丘奇的家，在查理斯非常暴力的開門方式下進到房間內，卻發現丘奇早被人抓走。 Kenway撕下了丘奇照片的頭像以做參考，二人前往市區偷聽的對話丘奇鄰居的對話尋找線索。 橘黃色標記的人物即是在沒有發現Kenway情況下中立的人物，靠近他們的聲音範圍能聽到他們的說話，但是靠太近了會被發現而導致任務失敗。 在拐角處會進行竊聽教學，當黃色標記內部裝滿的時候需要趕緊掩藏自己，在這裡只需要站在靠牆的兩個路人中間即可。 在他們離開後，Kenway前往教堂，在教堂樓頂搜索目標進行一次”信仰之躍”,跳到樓下裝滿樹葉的垃圾車中。 在綠色區域地帶有兩隊巡邏的衛兵，需要在他們的聲音範圍內偷聽並且不會被發現，他們比較好對付，可以混在行人中間或者躲在垃圾車裡。 再在房間後面偷聽一段對話，竊聽任務完成，查理斯與Kenway會和。 二人進入紅色區域，先假裝路人再靠著倉庫旁邊的牆走能在不被發覺的情況下到達倉庫。 看見丘奇正面對生命威脅。 進入倉庫後先用火藥槍將丘奇前面的看守殺掉，否則一旦驚動他會第一時間解決掉丘奇導致任務失敗。 消滅掉倉庫內的三個敵人後，將丘奇帶回旅館。
經過調整，丘奇的精神狀態好了許多。 他告訴Kenway之前在一個名叫Silas Thatcher的手裡見過類似的圖案。 離開旅館找到查理斯，查理斯帶Kenway以新兵身份混入了英軍營地，在營地中見到了正在大發雷霆的General Braddock和John Pitcairn，Braddock是Kenway曾經非常重要的朋友，但是此時卻刻意為難Kenway。 於是查理斯想出一個辦法，喊Kenway一起跟隨Braddock的巡邏隊，保持巡邏隊在視線範圍並且不被發現，被巡邏隊注意到的話有15秒的時間掩藏自己的身份。 到了合適的地點，查理斯會衝到Braddock面前對他進行嘲諷並且潑他一身髒水，Braddock會帶著手下追趕逃跑的查理斯，Kenway也追上去，在查理斯被抓到的地方與巡邏隊反生戰鬥，將巡邏隊全滅，與失去反抗能力的Braddock對話，Braddock同意讓John Pitcairn協助他們接下來的任務。
在旅館二樓與查理斯對話進入劇情，Kenway一行人埋伏在街區，等待押送奴隸的隊伍出現到他們安排的固定埋伏點開始進攻，全滅敵人。 接下來Kenway與印第安美眉兩個人駕著囚車前進，敵人頭上出現黃色符號的時候就按下LB鍵就會有潛伏的士兵將他們殺掉。 進入營地，先去到營地的右邊，利用自身潛行的特點，到最邊緣，先使用吹口哨吸引燒飯的士兵過來送死，再吹口哨把巡邏至此的隊長殺掉。 回到隊伍與自己人一起化妝成英軍潛入營地，外面的兩個奴隸很好救援，只需要躲藏在附近的垃圾車內，吹口哨將巡邏的高級尉官引到垃圾車邊等他身上亮光的時候可以直接使用X拖到垃圾車內殺掉。 船上的奴隸則需要通過游泳避開巡邏的士兵，然後等船上的士兵分開的時候將看守奴隸的士兵刺殺掉救出奴隸即可。 進入正面戰鬥，開場Kenway需要按住A鍵拉對方的士兵當擋箭牌擋下火槍的攻擊，之後的場地內的敵人無法全部消滅，必須等到空隙利用城門旁邊的箱子爬上城牆，將正在指揮戰鬥的Silas Thatcher 擊殺。 Silas表示與主角無冤無仇，Kenway想了想確實沒什麼過節，於是轉身把Silas交給了差點被他手下玩死的丘奇。 查理斯問Kenway接下來的安排，Kenway說“等吧”，卻只注視著那位救回來的印第安美眉。
| Sequence 3 |
1755年，冬天的波士頓，Kenway來到旅館，他有太多想從那個印第安女人身上得到的答案，但是上次拯救了她的部落就不辭而別了，讓查爾斯去附近打聽到她的下落。
接下來Kenway要經過一段長途跋涉（要經歷兩個場景切換），找到前線地帶的查爾斯。 查爾斯調查得知女人最近在附近出沒過，於是帶來了馬匹，騎上馬與查爾斯一起在雪地中尋找她的下落，前進後Kenway發現了熄滅不久的篝火，於是可以肯定他們已經很接近當前所在位置了。
圖中綠圈的紅點就是她所處位置。 看見跪在雪地上祈禱的印第安女人，她完全沒有感覺到狼群的靠近，查爾斯開槍擊斃了撲向她的狼群，但槍聲也使她感到恐懼。 Kenway嫌查爾斯壞了事，快速向她追趕過去，卻被剩下的狼纏住，接下來要進行一段與狼戰鬥的QTE（按鍵擊殺），一般都以B鍵起手，判定時間很短，感覺比其他遊戲的QTE難很多。 殺掉狼群後繼續追趕印第安女人。 如果不幸被狼咬死了，就得去雪巖附近重新激活任務，但是那時候看不見她跪在地上祈禱的身影，靠近區域後她會直接跳到岩石上開始逃跑。
追趕了許久，女人終於停下了腳步。 Kenway以為她是個什麼都不懂的原始人，反而被她諷刺了一番。 她告訴Kenway自己的名字是Ziio（Kenway真是被吃死了）。 氣氛因為Kenway的表現融洽了許多的時候，Ziio問他想幹什麼，Kenway掏出了他得到的銅幣。 Ziio果然知道這東西的意義，但是似乎很不信任Kenway。 於是Kenway決定用點手段獲得她的信任。
Ziio告訴Kenway越來越多的印第安人被英軍驅趕出自己的地盤，Ziio想將所有部落聯盟起來對抗英軍的侵略。 Kenway一下子就猜出了總指揮是他的老戰友Edward Barddock，ziio懷疑的時候他馬上改口“連朋友都算不上”，並且決定殺掉Edward Barddock換取Ziio的信任。
Kenway帶著Ziio一起進入懷特旅館蒐集信息，Ziio比Kenway想像的要勇敢和見多識廣。 進入酒館後，Kenway在吧台和窗台邊能偷聽到Barddock最近的軍事活動的情報。 蒐集完畢後，他們準備離開，卻被英軍喊住。 原來英軍士兵並不是阻止Kenway離開，而是Ziio，Kenway笑了，非要給他一個表現的機會。 把英軍都揍趴在地上，自己也掛了點彩，卻也打動了Ziio。
二人來到英軍提起的要塞，碰巧有暴風雪，有馬車給軍營送補給物資，躲在馬車裡前進軍營。 進軍營有幾個任務要執行，首先可以選擇從側邊的草叢將下方位置的加農炮破壞掉。 再回到馬車附近，進入前面的草叢開始竊聽情報的任務。 竊聽任務沿路都有草叢可以隱藏自己，如果不打斷他們會一直前進到第二個加農炮前面，跟隨他們，等他們離開後，從另外一側，當柵欄上巡邏的衛兵轉身的時候迅速在加農炮上做手腳，然後躲會草叢。 敵人開始有AI，當發現有異常會前來搜索，但是不要害怕，只要不是平地，有掩體的時候，即使你站在他們面前他們也是看不見你的，但是小心千萬別被他們的身體碰到。 最後去加農炮旁邊的營帳中取得情報，就該原路返回去找Ziio了。 從得到的信息中得知Braddock暫時不在軍營，他們有足夠的時間安排計劃。 返回懷特旅館休息。
五個月後，雪融化了。 Ziio來到懷特旅館，告訴Kenway他們的聯盟建立了，新的營地就在北方。 是時候教訓Braddock了，Kenway早已安排好了一切。
Braddock的軍隊經過了，但是有一小隊士兵落單了，Kenway利用偷襲殺掉外圈的兩個士兵後，印第安人一起把他們全滅。 Kenway換上了英軍的軍服，駕著馬去營地見Braddock。
此時印第安人的攻擊開始了，Braddock才發現營地中被安插了許多Kenway的人，驅馬逃跑，被Kenway一直追到河邊，馬害怕水而停下了腳步。 Kenway想殺掉Braddock的時候被他忠心的部下救了，就在Kenway要被殺掉的時候，Ziio衝出來按住了Braddock的隨從，讓Kenway去追趕逃跑的Braddock。 其實完全不需要追趕，Kenway手中一直拿著已經上膛了的火藥槍。
擊斃Braddock，進入茫然的時間停滯的世界，Braddock認為世界如果被統一，一切都會變得美好，揮劍的目的就是為了未來。 在他死後，Kenway取走了他手上代表聖殿騎士身份的戒指。
Kenway成為了人生的贏家，不僅得到了印第安人的信任，還得到了Ziio的心，Ziio將他帶到了遺跡中，並且告訴了Kenway部落古老的傳說。 Kenway似乎讀懂了什麼.
離開了部落，回到旅館的地下室，他將Braddock的戒指戴到了查爾斯的手上，宣布查爾斯成為聖殿騎士的一員。
Desmond醒來，沒有得到想要的答案。 老爸要Desmond繼續去到Kenway的兒子Connor的回憶中尋找答案，Desmond非常反感自己父親讓自己做著做那的獨裁思想，他認為他們擁有同樣的祖先為什麼要他再去體驗一個六歲小孩的童年。 最後他一句“你的所作所為和聖殿騎士有什麼區別”惹怒了老爸，狠狠扇了Desmond一巴掌。
這時眼鏡兄來阻止他們之間繼續爭吵，匆忙岔開話題，提到要開啟這座塔得到最後的答案不僅需要Desmond在Animus中找到鑰匙，更需要提供動力的能量塊。 至於能量塊所在的位置，還需要時間鎖定。
老爸最後說服了Desmond繼續進入Animus尋找鑰匙，此時在Animus旁邊能夠看見女神的身影，卻一閃而逝，Desmond雖然不情願，但是責任感還是迫使他繼續下去。
| Sequence 4 |
場景開頭是Ziio的獨白，她相信Kenway是愛自己的，但是他太執著於完美的未來，她害怕自己的孩子變得和Kenway一樣為了所謂的目標可以冷血無情，即使已經懷上了Kenway的骨肉，也決定離開Kenway回到自己的部落。
1760年的Kanatahséhton，Kenway的兒子Ratonhnhaké:ton（簡稱Ton好了）正在偷看母親的日記，這時Kanen’Tó：Kon（後面簡稱Kon）等一群小伙伴喊他去森林玩捉迷藏，第一輪做鬼，要在綠色區域調查線索，找到線索後綠色區域會縮小。 將四個小伙伴都找出來後，輪到Kon做鬼，隨便找個地方躲起來。
一段時間過去了，Kon沒來找自己，Ton反而被查爾斯一行人抓住了。 查爾斯覺得很眼熟，沒有聯想到他是Kenway的兒子。 查爾斯等人在尋找Ziio的部落，Ton拒絕告訴查爾斯位置，最後查爾斯還是決定不和小鬼一般見識，Ton問查爾斯名字，告訴查爾斯只要告訴他名字，一定會找到他。 在查爾斯的嘲笑聲中被Johnson打暈。
醒來時趕緊跑向自己的村莊，發現村莊陷入了一片火海。 到自己家門口，發現自己母親在裡面，但是門已經被火封死了。 從右邊的路到家的牆邊，牆面坍塌，使得Ton能進到家門，Ziio的雙腿被橫梁壓住了，固執的Ton想移開，卻沒有足夠的力氣，眼看房子就要坍塌了， Ziio讓Ton離開，Ton非常倔強，被幾個大人拉著才離開。 在他離開房子的一瞬間，屋子倒下，年幼的Ton就這樣失去了母親。
Ton並不軟弱，而且繼承了父親和母親矯健的身手。 而相反Kon因為胖的原因總被部落的人取消，Ton於是決定教Kon爬樹與打獵的技巧。 首先帶著Kon去蒐集鷹的羽毛，Ton靈巧地穿梭在樹林間，在通過樹枝過河的時候，Kon掉到了河裡，只能回去救他。 然後Kon不敢去爬到山頂去取最高處的鷹的羽毛，Ton嘆了口氣，讓他去附近矮點的樹頂看看有沒有羽毛，而他看上了那個鷹的巢穴。 通過樹枝和岩石爬到山頂，取得羽毛後，老鷹回來了，受到驚嚇的Ton掉下懸崖，降落在自己早準備好的落葉堆中。 旁邊的Kon看傻了眼，說自己根本不敢爬樹，讓Ton蒐集夠了自己要的羽毛就去樹林教他打獵。 Ton對Kon的表現很失望。
沒辦法，只能繼續教他打獵的技巧。 首先是直接的用斧頭砍死或者用弓箭射殺動物，接下來是調查樹的底部，會發現有兔子經過的痕跡，安裝下陷阱，一段時間後回來取兔子肉。 最後一項是調查野鹿喜歡吃的植物，可以取得誘餌並且標記出附近活動的野鹿。 潛伏在草叢中，灑出誘餌，躲在一旁不要被野鹿看見，等鹿靠近的時候可以將其擊殺，取得鹿的肉和皮。 教了Kon這些技巧之後，Ton讓Kon自己去練習，而Ton還肩負著為族人生存的獵捕活動。 （完美達成任務的要求在遊戲中會提示，比較費時間，但是很簡單）
獵捕到足夠的食物後，與Kon匯合的時候，卻看到了神色緊張並且在逃跑的Kon，原來他背後跟了一隻巨大的黑熊。 使用QTE的遊戲方法躲掉熊的攻擊，此時的Ton是殺不掉熊的，但是可以嚇跑熊。
在村門口見到Kon，Kon感謝他又救了自己一次。 Ton卻很失望，他擔心Kon這樣下去會一無所獲。 這是Kon嘿嘿一笑，向Ton展示今天的教學成果，最後一句”I had a good teacher”中帶著自信回村莊去了，Ton也笑了，Kon比他想像的勇敢。
大長老要求Ton去見她。 她告訴Ton部落一直在守護一個不能被外界知道的秘密，所以才不允許Ton去找查爾斯等人復仇。 但是她明白改變不了Ton的想法，於是向Ton展示了他們一族守護的秘密之一—金蘋果。
在金蘋果的魔力之下，Ton的意識化為了一隻蒼鷹，在歷史的河流之上飛行，女神告訴Ton他們所掌握的秘密會與人類面臨的浩劫有直接關係，所有人類，包括Ton的族人都將在浩劫中隕滅。 Ton想阻止一切的話，就要去尋找一個叫Achilles的刺客，他會指引Ton走完以後的路，而Ton要做的就是找到那個符號，把帶有符號的東西帶回來。
Ton在河邊醒來，對大長老說自己想出去闖蕩，大長老把裝備都給Ton準備好了，讓Ton以後走自己的路，找到屬於自己的符號。 他自由了。
| Sequence 5 |
在前一章節中男主角得到了長老的允許，離開部落，去Davenport Homestead尋找一位老人，訓練自己的戰鬥能力。 經過長途跋涉來到了Achilles的家門口，卻被Achilles拒絕接見，就要下雨了，於是男主角在馬廄睡了一晚上，第二天再去敲門，Achilles乾脆不理他了，不放棄的主角又去後門敲門，仍被拒絕，氣急之下跳到陽台想闖入拜師，被老頭一下子撂倒在地。 主角不甘心放棄復仇的希望，又回到馬廄打算將就一晚。 晚上碰到了聖殿騎士的士兵，他們打算趁Achilles在睡覺強行闖入佔用莊園。 主角與士兵發生衝突，被打倒在地（戰鬥勝利後劇情也是主角輸），在主角被毆打的時候，老人默默地就把多餘的士兵都乾淨俐落地掉了。 處理完畢屍體，Achilles終於讓主角進了家門。 Achilles與主角談論刺客的使命，之後再領著主角來到自己的房間，在那些要除掉的聖殿騎士的最高層領導人，正是主角的父親Kenway。 主角的毅力與決心打動了Achilles，他決定訓練他，讓他成為一名合格的刺客。
六個月後，老頭駕著馬車帶主角前往波士頓，並且給主角取名Connor。 此時的波士頓處於聖殿騎士的統治之下，非常混亂。 Achilles讓Connor去雜貨店購買自己給出的清單上的東西，只需要告訴老闆馬車的位置就夠了，找到雜貨店與老闆交談後回去找老頭子。 此時街上的遊/和諧/行活動變得非常劇烈，軍隊與市民的衝突變得強烈。 Achilles帶著Connor來到廣*場，見到了已經成為聖殿騎士領導人的父親Kenway，老頭子命令Connor追蹤剛與Kenway交談的士兵，如果士兵消失在視野15秒將任務失敗，一路都是情緒非常激動的市民，非常好掩飾自己。 跟隨士兵到了房頂，原來Kenway剛剛下令使用武力鎮壓示*威活動，刺殺掉下令的士兵，可是卻沒有料到一切早被Kenway看在眼裡，血腥鎮*壓照常進行，Kenway命令手下將Connor擊殺。 此時Connor處於會被攻擊的三級狀態，需要避開所有士兵的視線，躲過一段時間後才會消除。 在警報消除後，Connor在城市裡尋找Achilles，此時他處於被通緝的狀態，被士兵發現仍會被攻擊。 避開士兵來到之前馬車位置，發現Achilles已經離開了，Samuel Adams前來與Connor交談，他受Achilles委託協助Connor逃離波士頓，全城都有Connor的通緝令，但是在這個人與人之間不存在互相幫助的城市，只要撕掉就沒幾個人記得住。 撕掉兩張自己的通緝令後，找到Adams，會介紹認識城市中的傳言散播者，以後在非紅色區域被攻擊都可以通過給錢的方式消除追蹤。 Adams要求Connor護送自己到綠龍旅館。 旅館已經被英軍封鎖，在任意一入口先從高處尋找刺殺點，消滅掉一個再迅速打倒另外一個守衛，之後呼喚Adams進入，在牆壁中找到暗道，在暗道盡頭撬開門鎖，到達地下通道的一處出口，此後當碰到帶有地下通道標識的建築，便能觸摸後選擇城市自由來往了。 離開地下通道，在列印店找Adams，Adams告訴主角如果被追殺的太緊進入附近的列印店便可大幅度降低曝光程度。 最後，Adams將主角帶到碼頭，告訴主角最後一種快速移動的方式–輪船。 Connor對Adams所做的一切非常感激。
告別Adams，坐船回到Davenport Homestead，首先要去找老頭子算賬。 Achilles一臉無辜地表示經驗比學習重要，這次只是為了給他實踐的機會，Connor通過了測試，Achilles將自己曾經作為刺客的裝備送給Connor。 交談時有人敲窗求助，與其對話才知道他同伴被水沖走了。 追上他，在河邊能看見急流中有個人抓著樹木被沖走，不遠處就是瀑布。 Connor利用強大地叢林求生技巧，在樹木間穿梭追上流木的速度，木頭有兩個卡住一小會的地方，一個在半路，另外一個是瀑布前一些的位置，最好不要掉下水，不僅拖速度還會影響成績。 救起村民後，遊戲的家園功能開啟，以後完成房子圖標的任務將增加家園定居者的數量。 Achilles告訴Connor已經沒有能教他的東西了，離開時對Connor說讓他有空就去他的小屋看看他。 第二天Achilles又來了（做刺客的老頭真是寂寞），帶著Connor去找Robert Faulkner，Robert是一位愛自己船如命的酒鬼，卻也是一位經驗豐富的航海家，因為缺少錢和材料修理自己的愛船而離開大海。 Achilles會交給Connor如何進行資源交易。 幾個月後，Robert的船在Connor的幫助下終於修好了，但是還缺少了武裝。 於是一行人駕著修好的Aquila號前去Martha’s Vineyard購置武器，沿路Robert會教主角駕駛船隻。 Robert在酒館和老朋友們聊天的時候，Connor找到聖殿騎士的長官問查理斯的下落，眼看衝突在即，酒館老闆娘出面化解，讓Robert一行離開。 裝備了武器後，Connor將學習海戰技巧（按住LT，轉動左搖桿鎖定目標後鬆開為旋轉炮攻擊，按住RT，轉動搖桿鎖定目標後鬆開為加農炮攻擊，前者對小船隻有明顯效果，後者一般用於大船。當敵方船隻發射砲彈的時候，按下X鍵可避免對船上人員的傷害）。 學習完畢後，一行人開著Aquila號開開心心地找聖殿騎士的船出氣（…….）使用旋轉炮消滅兩艘船，並且以娛樂的心態（…… ）躲過對方三次砲彈的衝擊後，任務順利完成。 一行人回到家園的碼頭，Robert表示非常開心，隨時歡迎Connor再來他的船上一起航行。 回到Achilles的住處，Achilles因為Connor的不辭而別感到傷心，Achilles一邊捨不得，一邊卻很欣慰Connor的成長。 把那套刺客信條的標誌性衣服送給了Connor，並且宣佈Connor是兄弟會的正式成員。
時空轉回現代，機器沒電了，剛醒來的Desmond就被安排去曼哈頓取能量塊，正被Connor故事吸引的Desmond乾脆地接受了任務。 前往曼哈頓，使用攀登的技巧借助大樓外圍的建築材料爬到能跳到目標地點的高臺。 每段路對應一個自動存檔點，前兩段路通過跳躍鋼塊，房間外圍和穿過圓環鋼圈即可通過，最後的一段路需要先跳到大樓外部，再從外部翻到另外一側靠近塔的地方，爬上塔的最高處，往外圍走，看到直升機停降的平臺後觸發劇情。 加速向平臺方向跳躍，等到女配角喊命令的時候按下X鍵打開降落傘。 進入大樓取得能量，遇見Danniel Cross，劇情把他打暈，與其他人一起返回遺跡，重新開啟機器，繼續接下來的故事。
| Sequence 6 |
時間來到1773年，Connor已經長大成人，與Achilles的感情也深厚了許多。 Connor童年好友前來拜訪，但是帶來的並不是好消息，William Johnson打算把他們部落的土地收購，並且全然不顧部落的反對。 Connor非常憤怒，Achilles建議他先去波士頓找Adams，再決定之後的行動。
(Connor都敢兇Achilles了，在加上Achilles的吐槽，真像一對鬧彆扭的父子）
坐船來到波士頓，在碼頭遇見Adams。 Connor尋求Adams幫助找到William Johnson的位置，跟隨他前進，可以看見收稅員與市民的矛盾愈發激烈。 幫助第一個市民打到收稅員，市民表示感謝後離開，波士頓城內可以找到三個被收稅員圍毆的市民。 解救後在酒館找到Adams，之前被救的市民正是酒館的老闆。 Adams另外介紹了一位優秀的企業家William Molineux和酒館老闆Stephane Chapheau。 Molineux告訴Connor，Johnson在皇室的默許下進行走私生意，最近走私了一批茶葉正打算賣給他。 這正是個好機會，Connor走出酒館，撞到一個搬運箱子的年輕人，搬運的正是走私的茶葉，年輕人被嚇跑了。 Connor前往碼頭紅色區域，在前往紅色區域的途中能遇見第二個走私者，撞他把茶葉撞灑一地即可。 潛入碼頭，將碼頭的兩個走私貨品堆炸毀，每個貨品堆旁邊有兩個守衛，再炸毀走私船上的三個貨箱，安裝炸藥10秒後爆炸，需離開一定距離。 離開碼頭回到酒館路上能遇見第三個走私者，同樣手段將其計劃破壞。
回到酒館，老闆因為收稅官一次又一次地收稅和暴力執法，終於暴走了。 拿起菜刀就走向門外，Connor趕緊跟上去。 只見Stephane走出酒館就向著英軍守衛挑釁，守衛對其出手，Connor幫助Stephane打倒守衛，Stephane充滿激情的表演感染了周圍的人，所有他經過地方的人會自發跟著Stephane前進，發起遊*行，為Connor很好的製造了混亂。 Stephane看到英軍守衛就會衝過去挑釁，需要Connor在15秒內結束戰鬥（四人守衛戰需要在Stephane對守衛進行嘲諷的時候跳到屋頂等戰鬥開始時先將最能打的士兵秒殺掉才能控制住時間，和他單挑用的時間都不止15秒，或者先用火藥槍秒殺他，不過筆者的火藥槍留給其他守衛以節省時間）見到收稅官在敲詐小商販後，與Stephane對話可以開啟援助攻擊，使用Stephane的援助攻擊把收稅官砍死後，Stephane對Connor表示感謝並且願意追隨Connor。
在街上遇到Molineux，Molineux告訴Connor，Johnson仍不死心，並且把剩餘的貨物都堆積在了船上。 見到Adams，Connor想殺掉Johnson，Adams建議Connor斷掉他的財路就行，不需要殺掉Johnson。 Connor勉強接受了建議，晚上一行人潛入碼頭，發現守衛更多了。 Connor有了Stephane的援助攻擊，配合自己優秀的暗殺與格鬥技巧，很輕鬆將兩艘船上的守衛全部清理完畢。 在Molineux的帶領下大家開始往水裏扔走私貨物，Molineux等人的行為得到了市民的支持，卻遭到了英軍的攻擊，Molineux與Paul掩護剩餘成員銷毀走私品。 Connor往水裏扔了15箱茶葉後開始幫助Molineux與Paul對抗英軍，最後船上的走私茶葉全部被丟入大海，並且，留了最後一箱茶葉給Connor，當著Johnson的面丟進水裏。 Johnson臉色非常難看，同樣臉色非常難看的還有隨行前來的查理斯。
返回家園，Achilles告訴Connor如果不殺掉Johnson，這一切絕對不會結束。 事實證明，不聽老人言吃虧在眼前，六個月後，Connor童年好友又來了，主角被告之這次Johnson在強佔他們的土地。 Connor決定這次一定要除掉Johnson,童年夥伴帶著Connor來到Johnson Hall。 遊到對岸，再找岩石攀登到山頂，可以看見Johnson正在威脅另外一個部落，戰鬥一觸即發，主角出場救下了被槍指著的印第安人，印第安人與英軍產生混戰，Johnson企圖趁現在往山下逃跑，被Connor追上一匕首刺入胸膛（這是劇情，至於是用槍還是用刀或者斧頭隨玩家愛好）。 Jahnson死前告訴Connor他希望殖民者在侵蝕完全部大陸後，能變得友善，能不再與原住民發生衝突，相信時間會沖淡一切，最後兩個群體和平共處在沒有仇恨的新世界裡。 （天真還是諷刺？）他做的一切錯事都是因為他的信仰，扭曲的信仰。