作者:やなぎ しゅう
來源:篝火營地
遊戲中煉金系統分為採集、調合、重組道具、複製道具、寶石還原、武器強化、旅行瓶以及採集地調合等。
1、採集
採集是整個煉金環節的基礎，用於收集煉金所必需的素材。玩家的採集分為兩種，一種是無需工具的直接採集，另外一種則是需要採集工具的採集。無需工具的採集只要玩家在採集點按確定即可，而需要採集工具的採集則需要通過多種不同的採集工具來進行。
有不少的情況下，不同的採集工具對採集點進行採集，會獲得不同的素材。在調配素材的時候，需要注意使用對應的採集工具進行採集。基本的採集工具包括法杖、鐮刀、劈斧、錘子、捕蟲網和炎燒短杖。除了法杖以外，每樣工具都對應一個成就獎盃需要注意。
2、調合
這次《萊莎的煉金工房》的調合需要玩家完成各個環節，每個環節會要求玩家加入對應的材料物品，這些材料有時候會指定某一個種類，例如蟲類、植物類等，此時可直接放入只要是蟲或者植物的物品；另外一種情況下則會需要玩家加入指定名稱的材料。
除了材料外，每個環節還會對屬性由一定的要求，只有湊夠了對應的屬性才會點亮環節的效果，還有部分材料的環節需要屬性達到一定值之後才會解鎖下一個環節。
每個環節可投入的材料次數會根據角色的煉金等級而定，最大可投入的材料次數最終會達到12次。同時調合的成品基礎屬性也會隨著投入的材料品質有關係。
調合的成品可以繼承素材的各個特性，在解鎖了追加特性欄效果之後，成品可直接繼承素材的3個特性，並繼承特性效果。此外如果繼承複數個同類特性，那麼特性的等級會疊加上升。
調合系統中的配方功能表除了購買、委託、藏寶和金幣交換以外，大部分配方功能表需要通過配方變化獲得。配方變化指的是按照特定的方向調合後，會出現特殊的配方環節，按照要求使用指定材料後就會產生配方變化，解鎖新的配方。配方變化在遊戲中會在調合畫面的左下提示。
3、重組道具
重組道具系統能夠讓玩家消耗寶石在已完成的調合上再繼續進行調合，重組道具在寶石足夠和角色煉金等級足夠的情況下，允許玩家不斷加材料，另外一方面道具等級也不能高於角色靈活性。
要注意的是重組道具雖然可以再次完成環節的各個條件增加物品品質，但由於材料是不會影響最終調合道具的品質，因此還是需要第一次調合的時候注意品質來提升調合結果的屬性。
4、武器強化
在獲得動力爐後（打敗古城飛龍），玩家就能夠進行武器強化了，最多可獲得三個動力爐，武器強化環節中，可以對所有武器進行任意素材的投入來進行強化，強化屬性值會根據材料的種類和等級而變化，並且還會繼承素材的特性，但需要注意的是強化過程不可逆，以便精選更好的強化材料。
遊戲中隨著主線劇情會直接獲得兩個動力爐，第三個動力爐需要炎燒短杖在流星古城中獲得。
5、寶石還原
寶石還原就是分解系統，可對任何採集出來的素材和調合成品進行分解，分解所得到的寶石會隨著道具的等級而有變化，但不受道具品質的影響。由於本作的寶石會經常使用在各個煉金的途徑上，因此建議平時可以多刷一刷寶石。
本作大量刷寶石的方法一般採用的是後期利用調合+2的紅輝石一次性製作多個賢者之石，然後分解賢者之石繼續複製紅輝石，再製作多個賢者之石的方法。需要完成委託「生意不佳的雜工」後獲得「固態燃料的配方」，能製作混合油之後通過配方變化依次獲得「煉金油漆」、精靈的小瓶、核水晶元素之後，變化配方獲得賢者之石。
6、道具複製
道具複製可讓玩家僅消耗寶石來對調合素材道具進行完全複製，包括上述的賢者之石，一般情況下大部分調合道具素材手動製作一個後，再利用道具複製即可量產。但注意一定要有至少留一個道具。採集素材和怪物素材則無法複製。
道具複製需要進行到擊敗統天霸龍後才會解鎖。
7、旅行瓶
劇情進行到異界返回後，玩家可以通過將材料放入旅行瓶來創造出採集地且進入，相當於自製新地圖的玩法，自製地圖能採集到的素材等級主要受到放進旅行瓶的材料等級有關，但不受品質影響。自製地圖中出現的素材和怪物會在畫面中提示。
旅行瓶所創作出來的自製地圖一般較小，資源採集地點集中，因此相對正常世界中的採集更為方便，且對稀有素材採集有一定的幫助。因此多收集旅行瓶保存採集圖對素材收集非常有利。