來源：psnine
作者：whatthetruth
設定部分:
橫尾作品年代表(含DOD及Nier):全中文年代簡翻表
人類:最後的人類在AD4196年滅絕，期間部分外逃者建立月球資料庫
外星人:於AD5012襲擊入侵地球(Nier1)，期間被其製造的機械生命背叛滅絕(Nier2)
祭司:特殊型機械生命，Devola以及Popola雙子，通過儀式可將魔素送還原來的世界。
魔素:源自DOD1龍背1世界，E結局穿越到AD2003年新宿(Nier 1)，可導致人類白鹽化及紅眼黑化暴走。
GESTALT計畫:通過GESTALT技術分離人類靈魂，再通過Replicant系統製造無意識的複製人容器(擬真機械生命)，通過黑白書碰撞強制使靈魂回歸容器，達到拯救人類目的
GESTALT技術及Replicant技術:前者可分離人類靈魂，但分離出來的靈魂也容易暴走，特徵全身變成黑色帶有符文，狂暴。後者為製造複製人系統，但出乎意料的是複製人在後期出現自我人格，不願與原型人類融合，複製人可多次重生但不具備生殖功能。
BUNKER:由外逃到月球的人類留下的資料庫建造，作為反攻地球的指揮中心存在，從圖可見應該至少有3個，E結局沒說明可能在病毒侵蝕下全滅。
YorHa部隊:目前共有3系，9S的S系Scanner型，基地接線員Operator型，2B/A2=2E型，其中A型相當於E型原型機，B型則是正式量產型。均具備自我人格，可通過上傳備份系統更換身體重生。
POD:輔助型機器，為YorHa部隊提供輔助，具備一定事件判定許可權，具有專屬POD之間的網路系統，可互相交換資料。
YorHa計畫:由於人類早已滅絕，為了保持士氣，BUNKER系統網路從月球資料庫獲得部分人類遺留資料，持續的製造YorHa部隊機器人清洗地球安卓。同時因S型具備發現人類已滅真相的機能，因此同時派出E型鉗制S型，每當發現S型發現真相就開始滅殺S計畫，
簡言之是無限的輪回虛假的、為人類爭奪回地球的計畫。(已進行14次了)
四塔:三周目出現，為機械生命體製造，目的為搜集資訊，材料，製造大型導彈，在一定時間後發射導彈摧毀月球資料庫及BUNKER，已具備自我人格。四塔的名字分別是GOD SOUL MEAT 中樞。
地球安卓(ANDROID):具備一定程度的自我人格，內部主體核心損壞後不可重生，不具備YorHa部隊的重生能力(三周目Pascal Village劇情說明)
機械生命(MACHINE):由外星人製造入侵地球，具體資訊不明。
ADAM和EVE:由外星人製造改進，同為機械生命，後背叛反殺，也具有備份重生的能力(D結局)
病毒:可導致全機械生命狂暴化，具備傳染性(9S Hack Eve後被影響)
分析及猜測(前5條是結合前作腦洞):
1.ADAM及EVE的存在:由外星人改進製造而成，實際上應是成功進行GESTALT計畫靈魂回歸的人類然後被外星人改造成機械生命，改進後死亡也可重生(D結局)，但同為機械生命的安卓卻不能，形態差異也很大，因此這兩人是特殊的存在。
2.EVE黑化:從圖中可看出EVE具備前作魔王的黑化形態，胸口的兩人三眼圖騰為DOD世界天使教會標誌，確立魔素在Nier2依舊存在。
▲黑化EVE，胸口有天使教會圖騰(兩人三眼)
▲DOD三代天使教會圖騰標誌
▲靈魂體尼爾(前作魔王，也是GESTALT計畫裡提供魔素的穩定型靈魂體)
3.前作GESTALT計畫是否失敗:前作裡魔王死亡後這個計畫應該是失敗了，但聯想本作四塔的名字，EVE的黑化，較大的可能是沒有失敗反而被外星人改造成機械生命。而在ADAM以及EVE之前還存在部分改造機械生命體，在背叛外星人後以殘留的GESTALT計畫資料為藍本(9S hack塔的時候可在塔的網路獲得部分GESTALT計畫報告書)，建立四塔(具備黑白書功能)，除了摧毀月球計畫外(魔素影響)，也依舊製作複製人，搜集GESTALT化靈魂回歸，以此誕生的就是地球安卓，可能因技術原因只能製作成簡單的機器人形態無法像原來一樣製造擬真型(還有個是成本及難度問題)。
由此可見前作計畫以另一種形式進行下來，也就成為了現在Nier2的世界。
4.YorHa病毒=魔素:在1-3的前提下，人類靈魂已經回歸複製體，但由於缺少祭司(雙子祭司前作被殺，在Nier2復蘇後一直在抵抗軍基地呆著)，無法送還魔素，且四塔系統已經不是完全與原計劃一樣。隨靈魂回歸的魔素轉變為病毒潛伏在所有安卓中，EVE的黑化徹底引爆病毒發生。
5.地球安卓=人類:具備人格，也具有唯一性(不可重生)，因人類回歸複製體後，死亡=魂滅，不可重生(Pascal有說明過)，也是機械生命的一種，但由於四塔系統已經與原GESTALT計畫有出入，無法完全復原人格，大部分僅具備人類簡單的思維能力。且都因病毒緣故，也會發生暴走(Pascal Village的機器人暴走事件，教團的機器人自殺跳入熔漿和暴走)。
6.A2起源以及隊友:三周目可知，A與B實際同為E型，A則是E型的試做原型機，在早期A型也充當滅殺S型的職責，但隊友們在早期行動中已全滅，僅剩A2。A2倖存後還回去過BUNKER做詳細解釋,然後把她的人格複製了出來,轉移到2E型上。
7.A2的人格轉變:在A2殺死2B後可以明顯的看出A2從原本的冷淡開始有所轉變，是因2B死前將自我人格數據留存劍上，在A2拿走的時候影響A2，由A2代2B“照顧”9S。而A2與2B之間的特殊關係(同型號兩個系列,她倆的關係已超越單純的型號，同為2號E系)，BUNKER決定用她的人格作為2E人格的原因,是因為A2在極限狀況下的處理能力遠超其他的個體。
8.工廠教團及Pascal村落:共同點是都已經脫離了中樞塔網路，前者信奉死後成神的教條，後者則是集結了機械生命共同生活。前者有點像傳銷組織，到處尋找此類脫離網路的安卓加入他們洗腦信奉教條。(而為什麼脫離網路依舊會暴走，原因可能是原本他們都是回歸容器的真人類，但是缺少Devola Popola這種可以移除魔素病毒的祭司説明，所以在回歸容器後病毒也潛伏在身體，與是否斷網無關)
9.YorHa三系誰最強:在劇情裡，S型為最強model，具備hack功能，戰鬥能力也不俗，行動速度更快，但也因此危險性最大(容易發現真相)，所以僅作輔助型，E型均為主力(實際為了鉗制S型)，O型主要負責聯絡但也具備一定的戰鬥能力。
10.YorHa部隊為何會流血:遊戲裡並沒有對此作出解釋，只能結合前作來說明。YorHa部隊來由是逃亡至月球的人類所造，而部隊的可重生特性也符合前作的複製人特性，結合來看YorHa的製造技術也就是前作的Replicant技術。
11. 安卓的核心”黑箱(black box):實際上為敵方機械生命體的”核
人類軍在早期設計安卓時認為,如果使用一般的AI作為思考回路,以後將會存在道德淪理上的問題(作為月面偽裝的最後一步要把YorHa部隊滅口),於是便採用了把敵人元件再利用的方案。而事實上,採用敵人核心的安卓部隊,比起一般的AI有著更高的性能和互換性
但也並非事事順利,黑盒的安定性存在問題,在記錄上曾經有過”敵化”的案例,至於詳細內容則沒有交代。
12. EMIL劇情:二周目，在廢墟都市被砸出大坑後，可以去沙漠入口找EMIL說話。然後在森林入口的百貨公司一層右上角與月之花交互，EMIL出現接到任務，觸發找花支線，在這個支線裡可以看出EMIL經過了幾千年被遺忘的記憶逐漸恢復(月之花是前作凱妮的配飾)。最後分兩部分講述:
①在最後可去EMIL的花田，滿地的月之花，而EMIL也會闡述他的來歷(這一段是在1之後的劇情):在很久以前他作為最終武器，在外星人入侵時為了對抗率領眾多他的複製體對抗，而他只是眾多EMIL的其中一個，原型體以及夥伴花了很多時間整理出這片花田，而他作為複製體僅保留小部分記憶，至於原型體他也不知道到底還在不在了。隨後會給你一朵月之花，說對月之花許願可實現願望，獲得獎盃:
回憶的場所迎來了拜訪者
②首先完成①的支線EMIL MEMORIES，在下圖找到EMIL住宿地(峭壁上的水管)，沒完成①的話無法開門。一直深入最後房屋，偷走右側架子的面具，回地面找EMIL談話，再去住宿地HACK掉寶箱，轉頭出去觸發EMIL的BOSS戰，戰勝獲得獎盃:Naguhty Children，EMIL消失時表示這個住宿地留給你隨意使用，他不會介意。
擊破Emil（埃米爾）
13.A,B,C,D,E結局劇情(重點結局):
A:以2B為主視角進行遊戲，殺死ADAM EVE雙子以及被感染的9S，最後劇情銜接C(分歧點)
B:與A相同，只是以9S為主體
C:選擇A2。結局A2把9S病毒轉移自身並摧毀中樞塔網路，拯救9S(獎盃:A2結局)
D:選擇9S。結局A2及9S雙殺死亡，9S死前得知塔的功能已變，從原本摧毀月球改為發射方舟轉移安卓以及殘留的人類文明尋找下一個星球，ADAM詢問9S是否跟他們一起走。(獎盃:9S結局)
E:CD看過後觸發，POD發現2B 9S A2三人資料完好，開始集結所有POD修復三人(解答:可能依舊執行YorHa計畫，也可能讓三人跟隨方舟轉移。)
14.E結局STAFF表遊戲寓意(來自富熊@luna_noire的分析):
說實話尼爾最讓我眼前一亮的還是真結局製作人員彈幕那裡
首先我們明確遊戲中 android 和人在初始定義的區別，那就是AI的邏輯和人的思維，一個是純粹的固定計算結果，一個是擁有感情的不可測結果。而劇本中反復通過角色提到“android 沒有感情”，所表達的意思即人格不會隨著經歷而變化，但同時隨著遊戲劇情發展，可以很明顯的看出 android 顯然是能夠產生感情的，甚至可以說整個劇本都在圍繞著這一點，三位主角就不說了、Adam對仇恨和死亡的感情、Eva的兄弟情、Pascal對視為家人們的村民的感情、6O的百合花癡（？）、雙子的姐妹情（還有flag選項，但不影響後續）、乃至最後2B的POD的單純的感情等等，而Pascal保護的小 android 們的自殺，也明確表現出 android 是可以理解感情的，也就是是可以產生自我人格的。
另一方面遊戲中我們可以發現，當2B、9S的機體受損過嚴重或感染病毒時，遊戲本身的UI也會出現異常，甚至當你暫停遊戲切換到菜單還保持著異常。
我的理解是劇情中作為包括寄葉部隊在內的所有安卓們的記錄資料（或者說人格成長資料、記憶資料），和我們每個人操作著的遊戲存檔，被定義為同類的事物，也就是都是“獨一無二的資料”，只不過一種是遊戲中的機械生命角色，一種是玩家自己的化身。
二周目開始兩台作為整個計畫進程的觀察者的POD開始一遍觀察一邊對話，直到真結局那裡它們最終放棄了自己的職責，與玩家合作開始改變遊戲角色命運，而這麼做代表著他們要背棄整個觀察計畫，而這麼做自然要突破限制，限制是什麼呢？是staff列表，換句話說，是遊戲本身。
Staff列表變化成之前遊戲中很常見的Hacking攻擊，只不過密度變得極高，然後會出現一堆已經救出了主角們的資料的玩家“刪除自己的遊戲存檔（save data）”幫助你擊破staff列表的阻礙，每個被刪除的存檔換來幫你擦一個staff列表的鬼畜彈幕，無數玩家的data支援最終幫助你擊破了staff列表，將主角們的data挽救了回來。
為什麼一定要刪除存檔呢？我的理解是，這裡實際上不是刪除的意思，而是“移動”的意思。因為玩家的存檔同樣被視作“獨一無二的資料”，和2B、A2等 android 等同，所以你的存檔並不是被“刪除”，而是在你的遊戲中主角們成功復活後，你的存檔按照你的“支援命令”（也就是實際的刪檔）離開了你的遊戲，前往其他尚未通關的人的遊戲，變成一次阻擋攻擊，幫助另一位玩家救出他的遊戲中的主角們。
也可以進一步的理解為，遊戲外的你，在通過遊戲裡的其他玩家的犧牲，救出主角們後，又犧牲遊戲裡的你，前往救出其他玩家遊戲中的主角。
結語:首先謝謝各位看完那麼多字。。本作尼爾2在劇情上至少不像前作那麼悲催，而且多結局(26個)讓人十分在意，各主支線的劇情也很吸引人挖掘，希望中文版尼爾2能早日發售(4.27)，當然，最好是獨立一套獎盃